在交通事故中，停运损失费的主次责任赔偿主要依据事故责任比例进行划分，具体赔偿方式如下：
一、赔偿原则与责任划分
赔偿原则：
- 停运损失费属于因交通事故导致的间接财产损失，根据《中华人民共和国民法典》及《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》的相关规定，侵权人应承担赔偿责任。
- 赔偿范围包括车辆因事故无法正常运营所产生的合理经济损失，如日均净利润损失、台班费损失等。
责任划分：
- 交通事故责任认定是划分停运损失费赔偿比例的基础。根据事故责任认定书，主次责任通常按照70%：30%或80%：20%的比例进行划分，但具体比例可能因地区、案件情况而有所不同。
- 主要责任方需承担较大比例的赔偿责任，次要责任方则承担较小比例。
二、赔偿金额的计算方法
停运损失费的计算需结合车辆实际停运时间、日均收入情况等因素综合判定。以下是几种常见的计算方法：
纯利润法：
- 公式：日均净利润 × 停运天数
- 适用场景：有完整财务记录，能够准确核算日均净利润的车辆。
- 示例：若一辆货车日均净利润为1000元，因事故停运20天，则停运损失费为1000元/天 × 20天 = 20000元。
台班费法：
- 公式：单日台班费 × 停运天数
- 适用场景：固定成本占比高，难以准确核算日均净利润的车辆。
- 示例：若一辆重型货车的单日台班费为1200元，因事故停运15天，则停运损失费为1200元/天 × 15天 = 18000元。
行业标准法：
- 公式：同类车型日均收入 × 行业利润率 × 停运天数
- 适用场景：无详细数据支撑，但可参照当地同行业平均利润率估算损失的车辆。
- 示例：若同类货车日均收入为1500元，行业利润率为15%，因事故停运10天，则停运损失费为1500元/天 × 15% × 10天 = 2250元（此示例为简化计算，实际计算中需考虑更多因素）。
三、赔偿主体与保险赔付
赔偿主体：
- 主要责任方和次要责任方均需根据事故责任比例承担停运损失费的赔偿责任。
- 若责任方为法人或其他组织，则由该法人或其他组织承担赔偿责任。
保险赔付：
- 交强险通常不赔偿停运损失费，但商业三者险可能根据条款约定进行赔付。
- 若商业三者险未将停运损失列为免责范围，且保险公司未就免责条款进行充分提示和说明，则保险公司应在保险责任限额内对停运损失进行赔偿。
四、证据要求与争议解决
证据要求：
- 基础材料：交通事故责任认定书、维修证明、停运时间证明。
- 关键证据：运输经营许可证、挂靠协议（证明合法经营资质）、近半年运营收入明细表及完税凭证（或银行账户流水及客户结算单）、同行业平均收入数据（可通过统计局报告或行业协会获取）。
争议解决：
- 双方可首先尝试通过协商的方式解决争议，达成赔偿协议。
- 若协商无果，受害方可向法院提起诉讼，由法院依法裁决。在诉讼过程中，双方应提供充分的证据支持各自的主张。
五、实际案例参考
案例名称：某物流公司诉肇事司机停运损失纠纷案
- 基本案情：物流公司货车在高速被追尾，维修耗时25天，主张按日均净利润2000元索赔5万元。
- 判决结果：法院采纳近三个月平均日净利润1800元的证据，扣除5天非必要维修时间，最终支持4.05万元（即1800元/天 × 22.5天，其中22.5天为实际停运天数减去非必要维修时间）。
- 裁判要旨：强调停运损失需与实际经营能力匹配，且权利人应尽到减损义务。
在实际操作中，建议您根据具体情况收集并整理相关证据材料，以便在协商或诉讼过程中维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。