结论前置：对于被告被羁押一年以上的民事案件，其管辖法院的确定需根据具体情况来区分，一般由被告被监禁地或被采取强制性教育措施地的人民法院管辖，但也有一些特殊情况需要综合考虑。
一、一般情况下的管辖原则
被告被监禁或被采取强制性教育措施一年以上的：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，若被告被监禁或被采取强制性教育措施已超过一年，则由被告被监禁地或被采取强制性教育措施地的人民法院管辖。这一规定主要是考虑到被告长期处于被羁押状态，为便利诉讼活动的进行和保障当事人的合法权益，将管辖法院确定在被告被羁押地。
- 示例：甲因犯罪被羁押在A市某监狱已超过一年，乙欲就与甲的合同纠纷提起诉讼，此时应由A市（被告被监禁地）的人民法院管辖。
原告住所地或经常居住地管辖的例外情况：
- 通常情况下，对被监禁的人提起的诉讼，由原告住所地人民法院管辖；原告住所地与经常居住地不一致的，由原告经常居住地人民法院管辖。但在被告被监禁或被采取强制性教育措施一年以上的情况下，这一原则不再适用，而是由被告被监禁地或被采取强制性教育措施地的人民法院管辖。
二、特殊情况下的管辖原则
双方当事人都被监禁或被采取强制性教育措施的：
- 如果双方当事人都被监禁或被采取强制性教育措施，且被告被监禁或被采取强制性教育措施的时间未超过一年，则一般由被告原住所地人民法院管辖。
- 示例：甲和乙原来都居住在上海，后两人都因犯罪被羁押，甲被羁押在广州某监狱，乙被羁押在深圳某监狱，且羁押时间均未超过一年。此时，若甲起诉乙，应由乙原住所地（上海）的法院管辖。但若乙已经被羁押超过一年，则由乙被羁押地（深圳）的法院管辖。
涉及不动产等专属管辖案件的：
- 对于涉及不动产纠纷、港口作业中发生的纠纷以及继承遗产纠纷等专属管辖情形，应按照专属管辖规定确定管辖法院，不适用上述关于对被羁押人员诉讼由原告住所地或被告被监禁地管辖的一般规则。
- 示例：若甲被羁押在A市，乙欲就与甲之间的不动产纠纷提起诉讼，此时应由不动产所在地的人民法院管辖，而非由A市（被告被监禁地）的人民法院管辖。
三、实际操作中的建议
- 确定管辖法院前，应详细了解被告的被羁押情况：包括被羁押的地点、时间等，以便准确判断应由哪个法院管辖。
- 准备充分的诉讼材料：包括起诉状、证据材料等，确保诉讼材料的完整性和准确性，以保障当事人的合法权益得到有效维护。
- 如有需要，可寻求专业律师的帮助：虽然我在这里为你提供了详细的法律解释和建议，但在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同。因此，如有需要，你可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更具体的法律建议。
综上所述，对于被告被羁押一年以上的民事案件，其管辖法院的确定需根据具体情况来区分。在实际操作中，应根据被告的被羁押情况、案件类型等因素综合考虑，选择适当的管辖法院。