与挂靠单位之间的矛盾起诉，案由的选择需根据具体纠纷的性质来确定。以下是一些可能的案由及对应的法律分析：

1. 挂靠经营合同纠纷：

   • 适用情形：若双方签订了挂靠经营合同，且矛盾主要围绕合同的履行、解释、变更或终止等方面，如挂靠费用支付、挂靠期限、挂靠期间的责任承担等。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于合同的规定，特别是关于有名合同（如委托合同、行纪合同等，若挂靠合同性质可归入此类）或无名合同的规定，以及合同法的总则部分，来处理挂靠经营合同纠纷。

2. 侵权责任纠纷：

   • 适用情形：若挂靠单位的行为侵犯了您的合法权益，如未经允许使用您的商标、专利，或挂靠期间因挂靠单位的过错导致您遭受损失等。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的规定，特别是关于一般侵权责任和特殊侵权责任（如产品责任、环境污染责任等，若适用）的规定，来处理侵权责任纠纷。

3. 不当得利纠纷：

   • 适用情形：若挂靠单位在没有合法依据的情况下获得了利益，且该利益与您的损失之间存在因果关系，如挂靠单位未支付应支付的挂靠费用却享受了挂靠带来的利益。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于不当得利的规定，来处理不当得利纠纷。

4. 其他特定纠纷：

   • 适用情形：根据矛盾的具体内容，还可能涉及其他特定的纠纷类型，如劳动争议（若涉及挂靠单位与您或您员工之间的劳动关系）、知识产权纠纷（如商标、专利的侵权或使用许可纠纷）等。
   • 法律依据：根据相关法律法规中关于特定纠纷类型的规定，来处理这些纠纷。

在起诉前，建议您：

• 收集证据：包括挂靠经营合同、相关交易记录、沟通记录、损失证明等，以支持您的诉讼请求。
• 明确诉求：清楚您希望通过诉讼达到什么目的，如要求支付挂靠费用、赔偿损失、停止侵权等。
• 咨询专业律师：虽然这里我为您提供了一些基本的法律分析，但每个案件都有其独特性，因此在实际操作前，建议您直接向我咨询，以便更准确地确定案由和制定诉讼策略。

最后，需要强调的是，案由的选择对诉讼的成败至关重要，它决定了案件的法律适用和审理方向。因此，在决定起诉前，务必谨慎选择案由，并充分准备相关证据和法律依据。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。