若遇到以合作协议名义掩盖劳动关系的情况，劳动者可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 明确劳动关系与合作关系的关键区别：

   • 劳动关系：通常涉及固定的工作时间、工作地点、工作任务的分配，以及劳动者需遵守用人单位的规章制度等。在劳动关系中，劳动者享有劳动法规定的各项权益，如最低工资标准、社会保险、带薪休假等。
   • 合作关系：则更多是基于双方平等自愿的原则，合作双方通常各自独立承担风险，合作内容、方式、期限等由双方协商确定，且合作方一般不受另一方规章制度的严格约束。

2. 收集证据证明实际劳动关系：

   • 工作记录：如工作邮件、工作日志、项目报告等，这些可以证明你实际参与了用人单位的工作，并接受了其管理。
   • 工资支付记录：包括银行转账记录、工资条等，这些可以证明用人单位向你支付了劳动报酬。
   • 社保缴纳记录：如果用人单位为你缴纳了社会保险，这也是证明劳动关系的重要证据。
   • 其他证据：如工作证、工作服、同事证言等，这些也可以辅助证明你与用人单位之间存在劳动关系。

3. 与用人单位协商或申请劳动仲裁：

   • 协商：在收集到足够证据后，你可以尝试与用人单位进行协商，要求其承认劳动关系并补签劳动合同，同时补缴社会保险等。
   • 劳动仲裁：如果协商无果，你可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求确认你与用人单位之间存在劳动关系，并主张相应的劳动权益。在申请劳动仲裁时，你需要提交上述收集到的证据材料。

4. 法律后果与风险提示：

   • 用人单位风险：如果用人单位被确认以合作协议名义掩盖劳动关系，其可能面临劳动行政部门的处罚，如补缴社会保险、支付未签劳动合同的双倍工资等。同时，用人单位还可能因违反劳动法律法规而承担民事赔偿责任。
   • 劳动者风险：在维权过程中，劳动者需要注意保留好相关证据，避免证据丢失或损毁。同时，劳动者也需要了解劳动法律法规的相关规定，以便更好地维护自己的合法权益。如果劳动者在维权过程中存在过错或不当行为，也可能承担相应的法律责任。

在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同。因此，如果你遇到了以合作协议名义掩盖劳动关系的情况，建议你及时咨询专业律师（即我，姚文雅律师，专注于婚姻家庭、经济纠纷、劳动纠纷、合同纠纷、刑事辩护、交通事故领域），以便根据你的具体情况制定合适的维权策略。