结论：股东在公司已经不营业且法人不配合清算的情况下，可以通过向法院申请强制清算来维护自身权益。以下是具体的法律解释和操作步骤：
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释，当公司出现解散事由（如营业期限届满、股东会决议解散等）且逾期不成立清算组进行清算，或者虽然成立清算组但故意拖延清算，或者违法清算可能严重损害债权人或者股东利益的，债权人或者股东有权向人民法院申请指定清算组进行清算。
二、申请强制清算的条件
- 公司解散事由出现：这通常包括公司章程规定的营业期限届满、股东会决议解散、因合并或者分立需要解散等情形。
- 逾期不成立清算组或清算组故意拖延、违法清算：这是股东申请强制清算的前提条件之一，即公司内部清算机制已经失效或无法有效运作。
- 可能严重损害债权人或股东利益：这是法院决定是否受理强制清算申请的重要考量因素。
三、申请强制清算的步骤
准备申请材料：
- 强制清算申请书，详细说明申请强制清算的理由和事实依据；
- 公司解散的相关证据，如公司章程、股东会决议等；
- 股东身份证明及持股比例证明；
- 其他可能有助于法院了解案件情况的证据材料。
向有管辖权的人民法院提交申请：
- 通常应向公司住所地的人民法院提交申请；
- 提交申请时，应按照法院的要求缴纳相应的诉讼费用。
等待法院审查并作出裁定：
- 法院在收到申请后，会进行审查，并可能要求申请人补充材料或进行听证；
- 如果法院认为申请符合法定条件，会裁定受理强制清算申请，并指定清算组进行清算。
四、注意事项与可能后果
- 证据充分性：股东在申请强制清算时，应确保提供的证据充分、确凿，以支持其申请理由。
- 清算组组成与职责：清算组通常由法院指定，包括股东代表、有关机关及有关专业人员组成。清算组在清算期间应行使清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、通知或公告债权人等职责。
- 清算结果与股东权益：清算结束后，清算组应制作清算报告，并报经人民法院确认。清算报告确认后，公司即告终止。股东应根据清算结果按照持股比例分配剩余财产。
- 可能面临的法律责任：如果股东在申请强制清算过程中存在虚假陈述、隐瞒事实等违法行为，可能面临法律责任。
五、建议与进一步行动
- 咨询专业律师：虽然我在这里提供了一些基本的法律解释和操作步骤，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，建议股东在申请强制清算前咨询专业律师，以获取更具体、更个性化的法律建议。不过，既然你已经在向我咨询，我会尽我所能为你提供全面的法律支持。
- 积极配合法院工作：在申请强制清算过程中，股东应积极配合法院的工作，提供必要的证据材料，并按照法院的要求参与听证等程序。
- 关注清算进展：在清算过程中，股东应关注清算组的进展情况，确保清算工作按照法定程序进行，并及时维护自身权益。
如果你还有其他关于公司法务方面的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。