结论：故意损毁财物案件中，即使当事人不追究，也不一定能直接撤案。是否撤案需根据案件性质、损害后果及法律规定综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、案件性质决定撤案可能性

1. 自诉案件（轻微损害）
   若损毁财物价值较低（如未达到刑事立案标准，通常为5000元以下），且未造成严重后果，可能属于治安案件或民事纠纷。此时：

   • 当事人不追究：若双方达成和解，公安机关可能根据《治安管理处罚法》第九条调解处理，不再处罚；若已立案，当事人可申请撤案，公安机关一般予以准许。
     
   • 例外情形：若损毁行为涉及公共利益（如破坏文物、公共设施），即使当事人不追究，公安机关仍可依法处理。

2. 公诉案件（严重损害）
   若损毁财物价值较高（如达到刑事立案标准），或行为伴随其他犯罪（如故意伤害、寻衅滋事），则属于公诉案件。此时：

   • 当事人不追究无效：刑事案件由国家追诉，即使被害人出具谅解书，公安机关仍需继续侦查，检察院可依法提起公诉。
     
   • 例外情形：若犯罪情节轻微（如初犯、偶犯、积极赔偿），检察院可能作出不起诉决定，但需经法定程序审查。

二、损害后果影响撤案程序

1. 民事赔偿与刑事责任分离
   即使当事人不追究刑事责任，仍可要求侵权人赔偿损失。例如：

   • 双方签订和解协议，约定赔偿金额后，被害人可向法院申请撤诉（民事案件）；
     
   • 但刑事案件中，和解协议仅作为量刑情节，不影响公安机关立案侦查。

2. 社会公共利益介入
   若损毁行为危害社会秩序（如聚众闹事、破坏公共安全），即使当事人不追究，公安机关仍需履行职责。例如：

   • 损毁交通设施、电力设备等，可能构成“破坏交通工具罪”“破坏电力设备罪”，需依法追诉。

三、法律依据与实务操作

1. 《刑事诉讼法》第十六条
   规定“有下列情形之一的，不追究刑事责任……（六）其他法律规定免予追究刑事责任的”。但此条款适用于法定免责情形（如已过追诉时效），不适用于当事人单纯不追究。

2. 《公安机关办理刑事案件程序规定》第一百八十六条
   明确“经过侦查，发现具有下列情形之一的，应当撤销案件……（二）没有犯罪事实的”。若当事人不追究但存在犯罪事实，公安机关不得撤案。

3. 实务建议

   • 当事人角度：若希望撤案，需与对方达成和解，并积极配合公安机关说明情况（如损毁价值较低、无主观恶意）；
     
   • 侵权人角度：若面临指控，可主动赔偿、道歉，争取被害人谅解，以减轻量刑或避免刑事处罚。

四、特殊情形：未成年人或精神病人损毁财物

若损毁行为由未成年人或无刑事责任能力人实施，即使当事人不追究，公安机关仍需根据《刑法》第十八条处理：

• 未成年人：责令家长或监护人加以管教，必要时由政府收容教养；
  
• 精神病人：责令家属或监护人严加看管，必要时强制医疗。

总结：故意损毁财物案件能否撤案，需结合案件性质、损害后果及法律规定综合判断。若涉及刑事犯罪，当事人不追究仅能作为量刑情节，不影响立案侦查；若为轻微治安或民事纠纷，双方和解后可能撤案。建议根据具体情况咨询专业律师，制定应对策略。