结论：非法获取的公司流水本身不能直接作为起诉的依据，但可以作为证据在诉讼中使用，不过其证据效力可能会受到质疑。具体能否使用及如何使用，需结合获取方式、证据内容以及诉讼目的等多方面因素综合判断。
分析说明：
非法获取的公司流水作为证据的合法性：
- 根据我国法律规定，证据的收集必须合法，非法手段获取的证据可能不被法院采纳。如果公司流水是通过非法手段（如盗窃、侵占、非法侵入计算机系统等）获取的，那么这份证据在法律上可能存在瑕疵，其证据效力可能会受到质疑。
- 然而，如果非法获取的公司流水内容真实、与案件有关联，且没有其他合法证据可以替代，法院在审理案件时可能会考虑其证明力，但会严格审查其获取方式的合法性。
非法获取的公司流水在诉讼中的使用：
- 在诉讼中，如果一方试图使用非法获取的公司流水作为证据，另一方有权提出异议，要求法院排除该证据。法院将根据证据规则、法律规定以及案件具体情况，决定是否采纳该证据。
- 如果法院认为该证据虽然非法获取，但内容真实、与案件紧密相关，且没有其他更合法的证据可以替代，可能会在严格审查后，有限度地使用该证据。但这种情况较为罕见，且法院会明确指出该证据的瑕疵，并在判决中予以考量。
建议与风险提示：
- 建议：如果公司或个人需要获取公司流水作为证据，应通过合法途径（如向法院申请调查令、要求对方提供等）获取，以确保证据的合法性和有效性。
- 风险提示：非法获取公司流水不仅可能面临法律责任（如侵犯商业秘密、非法侵入计算机系统等），还可能导致证据无效，影响诉讼结果。因此，务必遵守法律法规，通过合法手段收集证据。
后续行动建议：
- 如果您已经非法获取了公司流水，并考虑在诉讼中使用，建议立即咨询专业律师，评估证据的合法性和有效性，以及可能面临的法律风险。
- 如果您需要获取公司流水作为证据，但尚未获取，建议通过合法途径申请或要求对方提供，以确保证据的合法性和诉讼的顺利进行。
如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。