国有投资费率合同结算并非必须使用清单计价方式，但需根据合同约定、行业规范及法律法规综合判断。具体分析如下：

1. 合同约定优先原则
   若合同中明确约定采用清单计价方式（如《建设工程工程量清单计价规范》GB50500-2013），则结算必须按清单执行。若合同未强制要求清单计价，双方可协商采用其他方式（如定额计价、总价包干等），但需确保计价方式明确、可操作，并符合行业惯例。

2. 行业规范与强制性标准
   根据《建设工程价款结算暂行办法》及地方性法规，国有投资项目通常要求采用清单计价，以保障透明度和公平性。例如，财政部、住建部联合发布的《关于完善建设工程价款结算有关办法的通知》明确，国有资金投资的建设工程应优先采用工程量清单计价。若项目涉及政府采购或招投标，清单计价可能是法定要求。

3. 例外情形与替代方案
   若项目具有特殊性（如抢险救灾、保密工程等），经主管部门批准后，可采用非清单计价方式。但需注意：

   • 替代方案需经双方书面确认，并留存完整计价依据；
     
   • 结算过程需符合《民法典》中关于“公平、诚实信用”的原则，避免因计价方式模糊引发纠纷。

4. 法律风险防范建议

   • 合同起草阶段：明确计价方式、调整机制（如材料价差调整）及争议解决条款，减少后期争议；
     
   • 结算阶段：保留完整的过程资料（如签证单、变更通知），确保结算依据充分；
     
   • 争议解决：若对计价方式有分歧，可依据合同约定申请造价鉴定或通过诉讼/仲裁解决。

总结：国有投资费率合同结算是否采用清单计价，需以合同约定为核心，结合行业规范和项目特性综合判断。若您需进一步分析具体合同条款或项目背景，可直接向我提供详细信息，我将结合实务经验为您定制解决方案。