针对您提出的“学校不让自主就业是否违法”的问题，这需要从多个角度来详细分析。

首先，我们要明确的是，高校毕业生的就业权益是受到法律保护的。教育部等相关部门已经多次强调，不准以任何方式强迫、诱导毕业生签订就业协议和劳动合同，这是为了保障毕业生的自主选择权和就业权益。如果学校存在强迫学生签订就业协议或限制学生自主就业的行为，那么这种行为是违反教育部相关规定的，也可能触犯到更广泛的劳动法律法规，如《劳动法》和《就业促进法》等，这些法律都强调了劳动者的自主择业权。

其次，从实际操作的角度来看，学校应该为学生提供就业指导和帮助，而不是限制学生的就业选择。学校可以通过开设就业指导课程、举办招聘会、提供实习机会等方式，来帮助学生更好地了解就业市场，提升就业能力，从而做出更明智的就业选择。如果学校以不合理的理由阻止学生自主就业，比如将毕业证书、学位证书的发放与签约挂钩，或者以户档托管为由劝说学生签订虚假就业协议等，这些行为都是不被允许的。

再者，如果学校确实存在不让自主就业的情况，学生可以通过多种途径来维护自己的权益。比如，可以向学校的就业指导中心或相关部门反映情况，寻求帮助；也可以向当地的教育主管部门或劳动监察部门投诉，要求相关部门进行调查和处理。

综上所述，学校如果以不合理的理由阻止学生自主就业，是违反教育部相关规定和劳动法律法规的。学校应该尊重学生的自主选择权，提供必要的就业指导和帮助，而不是限制学生的就业选择。如果学生遇到此类问题，应该积极维护自己的权益，通过合法途径来寻求帮助和解决。