关于非农户口协议宅基地的效力问题，这确实是一个涉及土地政策和法律规定的复杂议题。以下是我根据相关政策法规，为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，非本农民集体经济组织成员（即非农户口人员）取得宅基地的情况，并非一概而论，而是需要区分不同情形来处理。
因政府统一规划和批准使用宅基地的情况：
- 如果非农户口人员是因易地扶贫搬迁、地质灾害防治、新农村建设、移民安置等政府统一规划和批准而使用宅基地的，那么在退出原宅基地并注销登记后，他们可以依法确定新建房屋占用的宅基地使用权，并办理不动产登记。这种情况下，宅基地的使用权是得到法律认可的。
因继承房屋占用宅基地的情况：
- 非农户口人员如果因继承房屋而占用宅基地，也可以按规定进行确权登记。但需要注意的是，在不动产登记簿及证书附记栏会注记“该权利人为本农民集体经济组织原成员住宅的合法继承人”。这表明，虽然他们可以继承房屋并占用宅基地，但其身份仍然是非本农民集体经济组织成员。
历史遗留问题：
- 对于1999年《国务院办公厅关于加强土地转让管理严禁炒卖土地的通知》（国办发〔1999〕39号）印发前，回原籍村庄、集镇落户的职工、退伍军人、离(退)休干部以及回乡定居的华侨、港澳台同胞等，他们原在农村合法取得的宅基地，或因合法取得房屋而占用宅基地的，经公告无异议或异议不成立的，由该农民集体经济组织出具证明，可以依法确权登记。这种情况下，宅基地的使用权也是得到法律认可的，但同样会在不动产登记簿及证书附记栏注记相关身份信息。
违法占用宅基地的情况：
- 需要注意的是，如果非农户口人员在“国办发〔1999〕39号”文件印发后，违法占用宅基地建造房屋或购买农房的，那么这种行为是不予登记的，也就是说，他们无法获得宅基地的合法使用权。
综上所述，非农户口协议宅基地的效力取决于具体情形。如果是因政府统一规划和批准、继承房屋或历史遗留问题而取得的宅基地，那么其使用权是得到法律认可的；但如果是违法占用宅基地，则无法获得合法使用权。因此，在处理非农户口协议宅基地的问题时，需要仔细审查相关政策法规和具体情况，以确保合法合规。