乡政府司法员不可以直接调解行政诉讼案件，但可以在特定阶段参与相关调解工作，具体分析如下：
- 行政诉讼案件的调解主体具有法定性
根据《中华人民共和国行政诉讼法》第六十条，行政诉讼案件的调解仅适用于两类情形：
- 行政赔偿、补偿案件
- 行政机关行使法律、法规规定的自由裁量权的案件
且调解主体必须为人民法院，由法官主持或委托相关机构进行。乡政府司法员作为行政机关工作人员，不具备法律授权的调解主体资格，其直接介入行政诉讼调解属于程序违法。
- 司法员可参与诉前或诉中协调的例外情形
在行政诉讼立案前或审理过程中，若法院委托乡政府协助开展协调工作（非正式调解），司法员可在以下范围内活动：
- 协助法院向当事人释明法律、梳理争议焦点
- 传递双方和解意愿，但不得以行政权力施压
- 整理协调结果供法院参考，最终是否调解成功由法院裁定
此过程需严格区分”协调”与”调解”的法律边界，司法员不得越权作出具有法律效力的调解协议。
- 行政争议实质性化解的替代路径
若当事人希望在行政诉讼外解决争议，可通过以下合法途径：
- 行政复议阶段调解：根据《行政复议法实施条例》第五十条，复议机关可对符合条件的案件进行调解
- 人民调解委员会调解：通过基层群众性自治组织主持的调解程序，达成协议后可申请司法确认
- 行政争议调解中心：部分地区设立的专门机构，由法官、律师、行政机关代表等共同参与调解
实务建议：若您面临行政争议，建议优先通过行政复议或人民调解等非诉途径解决；若已进入诉讼阶段，可向法院申请启动调解程序，由法官主导协商过程。如需进一步分析具体案件的调解可行性，可直接向我咨询。