若判决中确定为共同受益人，但其中一方公司已不存在，后续赔偿的执行需分情况处理：

1. 公司注销且无财产承接主体
   若该公司已依法完成注销登记，且无权利义务承接主体（如未依法清算或未成立清算组），则其民事主体资格已消灭。此时，执行程序中需以该公司剩余财产为限承担责任。若财产已分配完毕或无财产可供执行，法院将裁定终结对该公司的执行程序。但需注意，若存在股东未依法清算导致公司财产贬值、流失或隐匿财产的情形，债权人可依据《公司法》及相关司法解释，追究股东或实际控制人的赔偿责任。

2. 公司被合并、分立或重组
   若该公司因合并、分立或重组导致主体变更，根据《民法典》第六十七条及《公司法》第一百七十四条，其权利义务由合并后存续的公司或新设的公司承继。此时，执行程序可直接变更被执行人为承继主体，继续执行其财产。债权人需向法院提交工商登记变更材料等证据，申请变更被执行人。

3. 公司被吊销营业执照但未注销
   若该公司被吊销营业执照但未完成注销登记，其民事主体资格仍存续，但需以清算财产为限承担责任。债权人可申请法院强制清算，若股东未在法定期限内成立清算组，债权人可申请法院指定清算组进行清算。清算后，若公司财产不足以清偿债务，债权人可依据《公司法司法解释（二）》第十八条，追究股东或实际控制人的连带清偿责任。

4. 公司进入破产程序
   若该公司已进入破产程序，根据《企业破产法》第十九条，执行程序应当中止，债权人需向破产管理人申报债权，参与破产财产分配。若破产财产分配完毕后仍有未清偿债务，除非债权人能证明股东存在出资不实、抽逃出资等情形，否则不得再向股东追偿。

实务建议：

• 立即向法院申请调查令，调取被执行公司的工商档案、财务记录等，明确其主体状态及财产去向；
  
• 若发现股东存在未依法清算、隐匿财产等行为，及时提起股东损害债权人利益纠纷之诉；
  
• 关注被执行公司是否涉及关联交易或财产转移，必要时申请法院撤销恶意转让行为；
  
• 若被执行公司无财产可供执行，可申请将其纳入失信被执行人名单，并限制其法定代表人高消费。
  

法律依据：

• 《公司法》第一百八十三条、第一百八十四条、第二百零四条；
  
• 《民法典》第六十七条、第六十八条；
  
• 《企业破产法》第十九条、第一百一十三条；
  
• 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第十八条至第二十二条。
  

如有进一步证据或细节需补充，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供更精准的执行方案。