关于员工休病假的时间认定问题，这主要取决于员工的实际工作年限、在本单位的工作年限，以及具体的病假情况。以下是根据相关法律法规和常见实践，给出的详细解答：

一、企业职工病假时间认定

对于企业职工，病假时间的认定主要依据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》。根据该规定：

1. 医疗期定义：医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。

2. 医疗期时长：

   • 实际工作年限十年以下的，在本单位工作年限五年以下的为三个月；五年以上的为六个月。
   • 实际工作年限十年以上的，医疗期根据在本单位的工作年限进一步细分，从六个月到二十四个月不等。

3. 累计病休时间计算：

   • 医疗期三个月的按六个月内累计病休时间计算；
   • 六个月的按十二个月内累计病休时间计算；
   • 以此类推，最长医疗期二十四个月的按三十个月内累计病休时间计算。

二、事业单位工作人员病假时间认定及工资待遇

对于事业单位工作人员，病假时间的认定及工资待遇可能因地区和具体政策而异。以安徽省为例，根据《关于工改后机关事业单位工作人员病事假期间工资待遇有关事项的通知》等相关规定：

1. 病假时长与工资待遇：

   • 病假在2个月以内的，本人基本工资全额计发。
   • 病假超过2个月不满6个月的，从第3个月起，根据工作年限的不同，基本工资按一定比例计发。
   • 病假超过6个月的，从第7个月起，同样根据工作年限的不同，基本工资按更低比例计发。

2. 跨年度病假处理：

   • 对于跨年度的病假，如问题中提到的2025年9月开始请病假，持续到2026年的情况，具体工资待遇的调整时间点可能因地区政策而异。
   • 一般来说，需要按照当地人社部门的具体规定来执行，可能涉及到从新年度开始后的某个月份起调整工资待遇比例。

三、实际操作建议

1. 查阅具体政策：员工和用人单位应首先查阅当地的具体政策文件，了解病假时间认定的具体规定和工资待遇的调整方式。

2. 咨询人社部门：如有疑问或不确定之处，可以向当地的人力资源和社会保障部门进行咨询，以获取最准确和权威的信息。

3. 保留相关证据：员工在请病假期间应保留好相关的医疗证明和病假条等证据，以便在需要时提供给用人单位或人社部门进行核实。

综上所述，员工休病假的时间认定主要依据其实际工作年限、在本单位的工作年限以及具体的病假情况。对于事业单位工作人员，还需考虑地区政策的具体规定。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询当地的人社部门或专业律师。