在职公职人员能否担任民间协会会长，需根据具体情况综合判断，但总体原则是在不违反法律法规、单位规定及不存在利益冲突的前提下可以担任。以下是对此问题的详细分析：
一、政策法规层面
主要规定：
- 对于党政机关领导干部，中共中央办公厅、国务院办公厅印发的《关于党政机关领导干部不兼任社会团体领导职务的通知》等文件有明确的规范，限制其兼任社会团体职务。然而，这一规定主要针对的是党政机关领导干部，对于在职公职人员（非领导干部或非党政机关人员）并无一概而论的禁止性规定。
地区与单位差异：
- 不同地区、不同性质的单位（如事业单位、国有企业等）可能有具体的实施细则或管理办法。有的单位可能规定，在职公职人员在一定条件下兼任协会职务需按干部管理权限审批，或需经过单位同意并进行备案。
二、任职限制条件
单位规定：
- 在职公职人员需首先遵守所在单位的规章制度。若单位有明文规定限制或禁止员工在外兼职，尤其是担任有报酬的职务，则不得违反。
协会章程：
- 想要担任民间协会会长，必须符合协会的章程要求，并通过合法的选举程序。这包括会员的资格、权利与义务，以及协会的组织架构和选举机制等。
利益冲突：
- 在职公职人员的本职工作与协会工作之间不得存在潜在的利益冲突。例如，不能利用职权为协会谋取不正当利益，也不能因协会活动影响公正执行公务。这是判断能否兼职的关键考量点。
审批与备案：
- 根据相关规定，某些情况下，在职公职人员在外兼职可能需要经过单位同意，并进行相应的审批或备案手续。在正式担任协会会长之前，必须确保已完成所有必要的审批和备案流程。
三、实际操作建议
事先咨询：
- 在考虑担任民间协会会长之前，在职公职人员应事先咨询所在单位的人事部门或法律顾问，了解清楚单位的相关规定和要求。
全面评估：
- 对自己的本职工作与协会工作进行全面评估，确保不存在利益冲突，且能够兼顾两者之间的平衡。例如，考虑工作时间分配、精力投入以及可能产生的利益关联等。
合规操作：
- 在确认符合所有相关规定后，按照规定的程序进行申请、审批和备案。确保整个过程的合法合规，避免后续产生法律纠纷或影响个人职业发展。
四、可能面临的法律后果
- 若在职公职人员未经批准擅自担任民间协会会长，可能面临单位内部的纪律处分，如警告、记过、降职等。
- 若因兼职行为导致利益冲突或违法违规行为，还可能面临更严重的法律后果，如行政处罚、刑事责任等。
综上所述，在职公职人员能否担任民间协会会长并非绝对禁止，但需严格遵守相关法律法规、单位规定和协会章程，并确保不存在利益冲突。在具体操作前，建议事先咨询所在单位的人事部门或法律顾问，并按照规定的程序进行申请、审批和备案。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。