在二审期间，若一人公司的法定代表人被羁押且公章丢失导致无人应诉，法院通常会采取以下措施处理：

1. 公告送达与缺席审理
   根据《民事诉讼法》第95条，若受送达人（公司）下落不明或无法通过其他方式送达，法院可公告送达诉讼文书（如开庭传票、上诉状等），公告期满即视为送达。若公司仍无人应诉，法院可依法缺席审理并作出判决。此时，公司可能因未行使抗辩权而承担不利后果。

2. 指定诉讼代理人或法定代理人

   • 若法定代表人被羁押但未丧失诉讼行为能力：法院可要求羁押机关协助通知法定代表人，或根据《民事诉讼法》第60条，指定其近亲属、公司员工或律师作为诉讼代理人参与诉讼。
     
   • 若法定代表人丧失诉讼行为能力（如被宣告无民事行为能力）：法院可依职权或利害关系人申请，指定监护人作为法定代理人代为应诉。

3. 调查核实公司现状
   法院可能要求原告提供证据证明公司处于“无人应诉”状态（如羁押证明、公章丢失报案记录等），或依职权调查公司工商登记、股东信息等，以确认是否存在其他适格诉讼主体（如实际控制人、隐名股东等）。

4. 中止诉讼的例外情形
   若公司能证明法定代表人被羁押与案件审理存在直接关联（如需其出庭陈述关键事实），可依据《民事诉讼法》第153条申请中止诉讼，待羁押状态解除后恢复审理。但实践中，此类申请被准许的概率较低，除非能证明案件结果必须依赖法定代表人参与。

实务建议：

• 公司方：若可能，应尽快通过股东会决议委派新代表或补办公章，并书面告知法院；若无法实现，可申请延期审理并提交羁押证明、公章丢失声明等材料。
  
• 对方（原告）：可同步申请财产保全，防止公司转移资产；同时注意收集公司“无人应诉”的证据，以推动程序推进。
  

风险提示：缺席判决后，公司若未在法定期限内上诉或申请再审，判决将生效并进入强制执行程序，可能对公司财产造成重大影响。

如有进一步细节（如公司类型、案件性质等），可向我补充说明，以便更精准分析。