针对您提出的“项目验收不通过经费怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
当项目验收不通过时，经费的处理方式主要取决于项目的具体情况以及相关管理规定。一般来说，如果项目验收结论为“不通过”，市科技部门（或相关管理部门）会根据项目承担单位履行科研责任、经费使用管理情况和验收意见，来要求项目承担单位进行相应的经费处理。
具体处理方式如下：
退回结余和违规使用的财政资金：
- 如果项目在实施过程中存在经费管理使用混乱、财政资金使用存在违规问题，且未在规定的期限内完成整改，那么项目承担单位需要退回结余和违规使用的财政资金。
后续经费不予拨付：
- 对于验收不通过的项目，除了要求退回结余和违规使用的资金外，市科技部门还会决定后续经费不予拨付。这意味着项目承担单位将无法再获得该项目的后续财政资助。
可能面临的额外处罚：
- 根据相关管理规定，验收不通过的项目承担单位或项目负责人还可能面临其他处罚，如在一定期限内不受理其牵头申请的市级及以上科技资金项目等。这是为了维护科研诚信和项目管理秩序，确保财政资金的有效使用。
特殊情况说明：
- 如果项目因不可抗拒因素（如自然灾害、政策变化等）导致无法继续实施或无法完成研究开发内容和目标，且项目承担单位能够证明其已履行勤勉尽责义务，那么市科技部门可能会根据实际情况对经费处理进行适当调整。
- 另外，如果项目承担单位主动提出终止项目并退回全部财政资金，市科技部门在审核确认后可能会直接批准，而不再进行进一步的经费处理。
建议：
- 为了避免项目验收不通过带来的经费处理问题，项目承担单位在项目实施过程中应严格遵守相关管理规定和经费使用要求，确保项目按计划进度实施并完成任务书确定的主要目标和任务。
- 同时，项目承担单位还应加强与市科技部门的沟通联系，及时汇报项目进展情况和经费使用情况，以便市科技部门能够及时了解项目动态并给予必要的指导和支持。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。