包工包料合同的结算方式需根据合同约定、实际履行情况及法律规定综合确定，核心原则是“以合同为依据，以实际履行为基础，以公平合理为补充”。以下是具体分析：

1. 合同有明确约定时：优先按约定结算

• 结算条款：若合同中明确约定了结算方式（如按工程进度分期付款、竣工后一次性结算、按工程量清单计价等），双方应严格按约定执行。例如：
  • 约定“每月25日提交已完成工程量报告，发包方5日内审核后支付80%工程款，竣工验收后付至95%，剩余5%作为质保金”，则按此流程结算。
  • 约定“固定总价包干”，则除非设计变更或合同约定可调整的情形，否则按总价结算。
• 注意事项：需审查合同是否对结算条件（如验收标准、付款时间、违约责任等）有详细约定，避免因条款模糊引发争议。

2. 合同无约定或约定不明时：按实际履行情况结算

• 工程量确认：若合同未约定结算方式，需根据实际完成的工程量结算。此时需注意：
  • 承包方应提供证据证明实际完成的工程量（如施工记录、验收单、签证单等）；
  • 发包方若对工程量有异议，需承担举证责任（如提供第三方审计报告）。
• 计价标准：若合同未约定单价或总价，可参考以下方式：
  • 参照合同签订时当地建设行政主管部门发布的计价依据（如定额标准）；
  • 参照市场同类工程的价格；
  • 委托第三方造价咨询机构评估。

3. 特殊情形下的结算规则

• 设计变更或工程量增减：若因发包方原因导致设计变更或工程量增加，承包方有权要求调整结算价款。需注意：
  • 变更或增减部分需经发包方书面确认；
  • 若合同未约定调整方式，可按实际成本加合理利润计算。
• 质量不合格或未验收：若工程未通过验收或存在质量问题，发包方有权拒付部分款项或要求返工，但需提供证据证明质量问题与承包方有关。
• 逾期付款责任：若发包方未按约定付款，承包方可要求支付逾期利息或违约金（合同有约定的从约定，无约定的可按LPR计算）。

4. 结算争议的解决途径

• 协商：双方可先通过协商达成补充协议；
• 调解：申请行业协会、人民调解委员会等第三方调解；
• 仲裁或诉讼：若合同约定仲裁条款，则提交仲裁；未约定的可向法院起诉。

建议：

1. 签订包工包料合同时，务必明确结算方式、付款条件、违约责任等条款，避免模糊表述；
   
2. 履行过程中注意保留证据（如工程量确认单、付款凭证、沟通记录等）；
   
3. 若发生争议，及时咨询专业律师，评估风险并制定解决方案。
   

如有具体合同或纠纷细节，可进一步向我说明，我会结合实际情况提供更精准的建议。