公司签订的不平等协议，其效力需根据具体情况判断，部分条款可能有效，部分可能无效，甚至整个合同可能无效。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同可能有效的情形
未违反法律法规强制性规定：
- 如果协议中的不平等条款并未违反法律法规的强制性规定，且是在双方自愿、平等协商的基础上签订的，同时一方在签订时未受到欺诈、胁迫或乘人之危等情形，那么该协议通常被视为有效。例如，协议中约定了较高的业绩目标或较严格的违约责任，但另一方因此获得了相应的对价或补偿，且这种约定未低于行业或地区的合理标准，则该条款可能被认定为有效。
双方真实意思表示：
- 即便协议中存在对一方不利的条款，但只要这些条款是双方真实意思的表示，且没有违反法律、行政法规的强制性规定，那么这些条款在合同中仍然是有效的。这要求双方在签订合同时，应当充分了解合同内容，并自愿接受合同条款的约束。
二、合同部分或全部无效的情形
违反法律法规强制性规定：
- 如果协议中的某些条款违反了法律法规的强制性规定，如约定一方无需承担法律责任、排除另一方主要权利等，这些条款将无效。然而，这并不影响合同中其他符合法律规定的条款的效力。例如，协议中约定“无论何种情况，甲方均不承担任何责任”，这样的条款因违反法律法规的强制性规定而无效。
存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形：
- 若一方在受到欺诈、胁迫或另一方乘人之危的情况下签订了不平等的协议，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构撤销该协议。一旦协议被撤销，它将自始没有法律约束力。例如，一方以不签订协议就不支付之前欠款相威胁，迫使另一方签订明显不利的协议，受损害方可通过法律途径主张撤销。
免除一方法定责任、排除另一方主要权利：
- 根据相关法律规定，如果协议中约定了免除一方法定责任或排除另一方主要权利的条款，这些条款将被视为无效。因为它们排除了另一方在合同中应享有的主要权利，并免除了一方的法定责任。例如，协议中约定“乙方在工作过程中发生任何伤亡事故，甲方概不负责”，这样的条款因排除乙方的主要权利而无效。
三、合同无效后的处理
- 如果协议被确认无效，且一方已经履行了合同义务（如提供了服务或支付了款项），另一方应当参照市场价格或行业惯例向履行方支付相应的报酬或补偿。报酬或补偿的数额可参照相同或相近岗位的市场价格或行业惯例确定。
四、实际建议
签订前仔细审查：
- 在签订协议前，双方应仔细审查协议条款，确保自身权益不受侵害。对于不平等或模糊的条款，应及时提出并协商修改。
保留证据：
- 在签订和履行协议过程中，双方应保留好相关证据（如邮件、短信、聊天记录等），以便在发生争议时能够证明自己的主张。
寻求法律帮助：
- 如果认为协议中存在不平等条款或对方存在欺诈、胁迫等行为，应及时向律师咨询并寻求法律帮助。律师可以根据具体情况提供专业的法律意见和解决方案。
总结来说，公司签订的不平等协议的效力需根据具体情况判断。在签订协议前，双方应充分了解合同内容并自愿接受合同条款的约束；在签订和履行协议过程中，应保留好相关证据并寻求法律帮助以维护自身权益。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。