结论：劳务费一般不能作为三项经费（职工福利费、工会经费、职工教育经费）的计算依据，对方开具的证明也不能改变这一基本原则。不过，具体还需根据劳务派遣协议的内容以及实际用工情况来综合判断。
分析说明：
三项经费的计算依据：
- 三项经费（职工福利费、工会经费、职工教育经费）通常是基于企业的工资薪金总额来计算的。工资薪金总额指的是企业支付给本单位所有职工的劳动报酬总额，这通常不包括劳务费。劳务费一般是指企业因使用外部劳务而支付的费用，这些劳务提供者并非企业的正式员工，因此其费用不计入工资薪金总额。
劳务派遣的特殊性：
- 在劳务派遣关系中，劳务派遣工虽然为用工单位提供劳动，但其劳动关系通常与劳务派遣单位建立。因此，从法律关系上讲，劳务派遣工的工资薪金应由劳务派遣单位支付，并计入其工资薪金总额。用工单位支付给劳务派遣单位的费用（包括劳务费）并不直接构成用工单位的工资薪金总额。
对方开具证明的影响：
- 对方（如劳务派遣单位）开具的证明，无论其内容如何，都不能改变劳务费不属于工资薪金总额这一基本事实。证明可能用于说明费用的性质、金额或支付情况，但无法改变法律对于工资薪金总额和三项经费计算依据的规定。
特殊情况下的处理：
- 如果劳务派遣协议中有特别约定，或者用工单位与劳务派遣单位之间有特殊的财务安排，使得部分劳务费被视为工资薪金的一部分（这种情况较为罕见且需要严格的法律合规性审查），那么这部分费用可能在一定程度上影响三项经费的计算。但这种情况需要具体的协议条款和财务安排作为支持，并且必须符合相关法律法规的规定。
行动建议：
- 审查劳务派遣协议：仔细审查劳务派遣协议中关于费用支付、工资薪金计算以及三项经费承担等条款，确保协议内容符合法律法规的规定。
- 咨询专业律师：如果对于劳务费是否可以作为三项经费的计算依据存在疑问，或者劳务派遣协议中有特殊约定需要解读，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见。
- 合规操作：在处理劳务派遣和三项经费相关事务时，务必确保合规操作，避免因违反法律法规而引发法律风险。
法律背景：
- 根据《中华人民共和国企业所得税法》及其实施条例等相关法律法规的规定，三项经费的计算依据通常是企业的工资薪金总额。劳务费作为企业因使用外部劳务而支付的费用，一般不计入工资薪金总额。
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