事业单位职工在检察院不起诉的情况下，是否会被开除，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 不起诉的性质与影响：

   • 检察院不起诉，通常意味着职工的行为虽然可能违法，但情节轻微，或者证据不足，不足以支持起诉。这并不意味着职工的行为完全无过错，只是从刑事法律的角度，认为不需要追究其刑事责任。
   • 不起诉决定对职工的刑事责任进行了排除，但并未直接涉及职工的行政责任或单位内部纪律责任。

2. 事业单位的内部管理规定：

   • 事业单位通常有其内部的规章制度和管理规定，这些规定可能涉及职工的纪律处分、解聘等条款。
   • 如果职工的行为违反了事业单位的内部规定，即使检察院不起诉，事业单位仍可能根据内部规定对职工进行纪律处分，包括警告、记过、降级、撤职、开除等。

3. 行政责任与刑事责任的区分：

   • 行政责任是职工因违反行政法规或单位内部规定而应承担的责任，与刑事责任是分开的。
   • 检察院不起诉，仅解除了职工的刑事责任，但不影响其可能承担的行政责任。

4. 具体案例与判断：

   • 在实际案例中，是否开除职工，往往取决于职工行为的性质、情节、后果以及事业单位的内部规定和态度。
   • 如果职工的行为轻微，且未对事业单位造成重大损失或不良影响，事业单位可能会选择从轻处理，如给予警告或记过处分，而不是开除。
   • 如果职工的行为严重违反了事业单位的内部规定，或者造成了重大损失或不良影响，即使检察院不起诉，事业单位也可能选择开除职工。

建议：

• 对于事业单位职工而言，如果面临检察院不起诉但可能面临单位内部纪律处分的情况，建议积极与单位沟通，了解单位的态度和内部规定，争取从轻处理。
• 如果认为单位的处分决定不合理或违法，可以依法向相关部门申诉或寻求法律援助。

总结：事业单位职工在检察院不起诉的情况下，是否会被开除，需根据职工行为的性质、情节、后果以及事业单位的内部规定和态度来综合判断。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。