国有企业发生3500万损失，需根据损失性质、责任归属及内部管理要求，分步骤采取法律及管理措施，具体处理方式如下：

1. 立即启动内部调查，明确损失原因及责任

• 调查范围：需全面核查损失产生环节（如投资决策、合同履行、财务管理、内部监管等），确定是否存在人为过失、违规操作或外部侵权行为。
• 责任划分：根据调查结果，区分直接责任人（如经办人员、部门负责人）与管理责任人（如分管领导、决策层），明确是否存在故意或重大过失。
• 法律依据：依据《企业国有资产法》《国有企业领导人员廉洁从业若干规定》等，对违规行为进行定性。

2. 根据损失性质采取针对性措施

• 若损失由外部侵权导致（如合同违约、诈骗、侵权行为）：
  • 民事追偿：通过诉讼或仲裁要求侵权方赔偿损失，需准备合同、交易记录、损失计算依据等证据。
  • 刑事报案：若涉嫌犯罪（如合同诈骗、职务侵占），立即向公安机关报案，配合刑事侦查。
• 若损失由内部管理失误导致：
  • 内部追责：依据企业规章制度（如《员工违纪处分条例》）对责任人进行处分（如警告、降职、解除劳动合同），涉及违法违纪的移送纪检监察部门。
  • 完善制度：修订内部管理流程（如审批权限、风险控制机制），防止同类损失再次发生。
• 若损失由市场风险或不可抗力导致：
  • 风险评估：分析风险是否可预见、可防控，若存在管理疏漏仍需追责。
  • 保险理赔：若企业投保相关险种（如财产险、责任险），及时向保险公司报案并提交理赔材料。

3. 依法履行报告及披露义务

• 向上级主管部门报告：根据《企业国有资产监督管理暂行条例》，国有企业需在规定时间内向国资监管机构报告重大损失情况，说明原因、责任及处理措施。
• 信息披露：若企业为上市公司，需按《证券法》及交易所规则披露损失事件及其影响，避免信息滞后导致股价异常波动或监管处罚。

4. 通过法律程序追偿或减损

• 诉讼/仲裁时效：注意民事诉讼时效（通常为3年）及仲裁申请期限，避免因超期丧失追偿权。
• 财产保全：在诉讼或仲裁前申请财产保全，防止责任方转移资产。
• 执行程序：若胜诉或仲裁裁决生效，及时申请强制执行，通过查封、扣押、拍卖等措施实现债权。

5. 加强后续合规与风险管理

• 合规培训：组织全员学习《企业国有资产交易监督管理办法》等法规，强化风险意识。
• 审计监督：定期开展内部审计，重点检查高风险业务领域（如对外投资、担保、资金拆借）。
• 责任追究机制：建立“损失终身追责”制度，对重大损失事件长期追溯责任，形成威慑。

提示：国有企业损失处理需兼顾法律程序与企业内部管理，建议根据具体案情制定方案。若有进一步细节（如损失类型、责任人身份等），可直接向我咨询，我将结合实务经验提供针对性建议。