针对您提出的“合同纠纷仲裁后申请了法院强制执行，但事业单位拒不付款”的问题，以下是我的详细分析和建议：
确认执行依据与程序：
- 首先，请确保您已经取得了仲裁裁决书，并且该裁决书已经发生法律效力。这是申请法院强制执行的前提和基础。
- 接着，您需要向有管辖权的人民法院（通常是被执行人住所地或财产所在地的法院）提交强制执行申请书，并附上仲裁裁决书等相关证据材料。
- 法院在受理您的申请后，会向被执行人（即事业单位）发出执行通知书，责令其履行义务。如果事业单位在规定期限内仍未履行，法院将采取进一步的执行措施。
分析事业单位拒不付款的可能原因及应对措施：
- 原因一：事业单位确实无财产可供执行：
- 在这种情况下，您可以向法院申请调查事业单位的财产状况，包括银行账户、房产、车辆等。如果确认事业单位确实无财产可供执行，法院可能会裁定终结本次执行程序。但这并不意味着您无法再追讨欠款，一旦发现事业单位有新的财产线索，您可以随时向法院申请恢复执行。
- 原因二：事业单位故意隐匿或转移财产：
- 如果您怀疑事业单位故意隐匿或转移财产以逃避执行，您可以向法院提供相关线索，并申请法院采取查封、扣押、冻结等强制措施。同时，您还可以考虑向公安机关报案，追究事业单位相关责任人员的刑事责任。
- 原因三：执行过程中存在程序或实体上的障碍：
- 执行过程中可能会遇到各种程序或实体上的障碍，如事业单位提出执行异议、申请再审等。在这种情况下，您需要积极配合法院的工作，提供必要的证据和材料，以维护自己的合法权益。
考虑其他法律途径：
- 如果法院强制执行仍然无法追回欠款，您还可以考虑通过其他法律途径来维护自己的权益。例如，您可以向事业单位的上级主管部门或相关监管机构投诉，请求其协助解决纠纷。
- 另外，如果事业单位的行为涉嫌违法或犯罪，您还可以向公安机关报案，追究其法律责任。
注意事项与建议：
- 在整个执行过程中，请保持与法院的密切沟通，及时了解执行进展情况，并根据法院的要求提供必要的协助和配合。
- 同时，请注意保留好所有与案件相关的证据材料，以备不时之需。
- 如果您对执行过程或结果有任何疑问或不满，可以及时向法院提出异议或申请复议。
总结来说，面对事业单位拒不付款的情况，您需要首先确认执行依据与程序是否正确无误；接着分析事业单位拒不付款的可能原因，并采取相应的应对措施；如果法院强制执行仍然无法解决问题，您可以考虑通过其他法律途径来维护自己的权益。在整个过程中，请保持与法院的密切沟通，并保留好所有相关证据材料。 如果您有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。