在起诉自然人时，是否可以将其一人公司列为被告，需根据具体情况和法律原则进行综合判断，一般情况下，若符合相关条件，是可以将其一人公司列为被告的。以下从不同角度进行分析：

一、法律原则与一人公司的特殊性

一人公司，即一人有限责任公司，是指只有一个自然人股东或者一个法人股东的有限责任公司。根据《公司法》的相关规定，一人有限责任公司的股东不能证明公司财产独立于股东自己的财产的，应当对公司债务承担连带责任。这一规定体现了公司法人人格否认制度，即当公司财产与股东财产混同，导致公司无法独立承担民事责任时，股东需对公司债务承担连带责任。

二、起诉自然人时列一人公司为被告的情形

1. 债务承担连带责任：

   • 若自然人作为一人公司的股东，且无法证明公司财产独立于其个人财产，那么在起诉该自然人时，可以同时将其一人公司列为被告，要求公司对债务承担连带责任。
   • 这种情况下，列一人公司为被告是基于公司法人人格否认制度，旨在防止股东滥用公司独立人格和有限责任逃避债务。

2. 公司作为共同侵权人：

   • 若自然人与一人公司共同实施了侵权行为，导致他人受损，那么在起诉时，可以将自然人和一人公司列为共同被告。
   • 这种情况下，列一人公司为被告是基于共同侵权理论，即多个主体共同实施侵权行为，应共同承担侵权责任。

三、实际操作中的注意事项

1. 证据收集：

   • 在起诉自然人并考虑将其一人公司列为被告时，需充分收集证据证明公司财产与股东财产混同，或者证明自然人与一人公司共同实施了侵权行为。
   • 证据可能包括公司财务报表、银行转账记录、合同协议等，以证明公司财产与股东财产的界限模糊或共同侵权的事实。

2. 法律程序：

   • 在起诉时，需按照民事诉讼法的规定，向法院提交起诉状、证据材料等，并明确列明被告为自然人和其一人公司。
   • 法院将根据双方提交的证据和法律规定，进行审理并作出判决。

3. 专业咨询：

   • 由于涉及公司法人人格否认制度和共同侵权理论等复杂法律问题，建议在起诉前咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。

总结与建议：在起诉自然人时，若符合相关条件（如公司财产与股东财产混同或共同侵权），是可以将其一人公司列为被告的。然而，这需要充分的证据支持和专业的法律判断。因此，在决定起诉前，建议咨询专业律师，以评估案件的可行性和风险，并制定合适的诉讼策略。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。