关于交通事故赔偿协议儿子代签是否有效的问题，这主要取决于儿子是否获得了父亲的合法授权以及具体的情况。以下分情况讨论：
儿子获得父亲明确授权：
- 如果父亲因为某些原因（如身体原因、不在场等）无法亲自签署赔偿协议，但他明确授权儿子代为签署，并且这种授权是合法有效的（比如通过书面授权书、口头授权且在场的第三方可以证明等），那么儿子代签的赔偿协议是有效的。这种情况下，儿子作为父亲的代理人，其签署的协议对父亲具有法律约束力。
儿子未获得父亲明确授权或授权不明确：
- 如果儿子没有获得父亲的明确授权，或者授权不明确，那么儿子代签的赔偿协议可能面临无效的风险。因为根据法律规定，代理行为需要被代理人的明确授权，否则代理行为可能不被认可。在这种情况下，如果协议已经签署，父亲可以主张协议无效，并可能因此引发法律纠纷。
特殊情况：表见代理：
- 还有一种特殊情况是表见代理。即使儿子没有获得父亲的明确授权，但如果相对方（如保险公司、对方车主等）有理由相信儿子有代理权（比如儿子之前经常代表父亲处理类似事务，或者父亲在公开场合表示过儿子可以代表他等），并且这种相信是合理的，那么儿子代签的协议也可能被认定为有效。这种情况下的判断会相对复杂，需要具体分析案件事实和相关证据。
法律建议：
- 为了避免不必要的法律纠纷，建议在签署任何涉及法律权益的协议时，都尽量确保由本人亲自签署。
- 如果确实需要他人代为签署，一定要确保获得合法有效的授权，并且最好通过书面形式进行确认。
- 如果已经发生了儿子代签赔偿协议的情况，并且存在争议或不确定是否有效，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况提供法律意见和帮助。
可能后果：
- 如果儿子代签的赔偿协议被认定为无效，那么可能面临重新协商赔偿事宜、甚至可能引发诉讼等法律后果。
- 如果协议被认定为有效，但后续发现存在欺诈、胁迫等情形，也可能面临协议被撤销或变更的风险。
总结：儿子代签交通事故赔偿协议是否有效，取决于是否获得父亲的合法授权以及具体的情况。在处理此类事务时，务必谨慎行事，确保所有法律手续完备且合法有效。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。