集装箱掉入海中，船公司是否会赔偿需根据具体情况判断，主要涉及责任认定、保险理赔及法律诉讼等环节。以下从不同角度为您详细分析：

一、责任认定角度

1. 承运人（船公司）责任

   • 法定责任：根据《海商法》及相关法规，承运人对责任期间内（通常为装船至卸船）的货物灭失或损坏承担赔偿责任。若集装箱掉落是由于船公司过失（如绑扎不牢、积载不当、航行操作失误等）导致，船公司需赔偿。
     
   • 免责情形：若船公司能证明事故由不可抗力（如台风、海啸）、托运人过错（如货物包装不合格、申报不实）或其他法定免责事由（如战争、罢工）造成，可免除或减轻责任。例如，因台风导致船舶剧烈摇晃使集装箱脱落，船公司可能无需担责。

2. 托运人/货主责任

   • 若事故因货物本身问题（如超重、重心偏移）或托运人未如实申报货物信息导致，货主需自行承担损失。例如，托运人未告知集装箱内装有易燃物，导致绑扎要求未被满足，最终掉落海中，货主需负责。

3. 第三方责任

   • 若事故由港口操作失误（如吊装设备故障）、其他船舶碰撞等第三方行为导致，受损方可向责任方索赔。例如，港口吊机故障导致集装箱坠海，港口方需赔偿。

4. 共同海损分摊

   • 若事故为保护船货共同安全而采取合理措施（如抛货救船）所致，根据《海商法》规定，受益各方（包括船公司、货主等）按比例分摊损失。例如，为避免船舶沉没而主动抛弃部分集装箱，相关方需共同承担损失。

二、保险理赔角度

1. 货物运输保险

   • 若货主已投保货物运输保险，且事故属于保险范围（如自然灾害、意外事故），保险公司将按约定赔付。需注意除外条款（如战争风险）可能影响理赔。例如，因恶劣天气导致集装箱掉落，若保险条款覆盖此类风险，货主可获赔。

2. 承运人责任险

   • 船公司通常投保承运人责任险以转嫁经营风险。若被认定需担责，其保险公司将代为履行赔偿义务，但赔偿限额受保单条款约束。例如，船公司因绑扎不牢导致集装箱掉落，其保险公司将在保额范围内赔偿货主损失。

三、法律诉讼角度

1. 协商调解

   • 优先通过行业组织或第三方调解机构协商解决争议，可快速达成赔偿协议并降低维权成本。例如，船公司与货主通过海事仲裁委员会调解，达成赔偿金额及支付方式的协议。

2. 仲裁程序

   • 依据运输合同约定的仲裁条款，向指定仲裁机构申请仲裁。仲裁裁决具有终局性且执行效率较高。例如，合同约定争议提交中国海事仲裁委员会仲裁，仲裁结果对双方均有约束力。

3. 司法诉讼

   • 在无仲裁协议或仲裁无效的情况下，可向事故发生地或被告住所地法院提起诉讼。需注意诉讼时效限制（通常为1年，自知道或应当知道权利受损之日起计算）。例如，货主因船公司拒赔，向事故发生地海事法院起诉，要求赔偿货物损失及利息。

四、其他注意事项

1. 证据保全

   • 及时收集现场照片、视频、检验报告、气象资料等证据，避免因证据灭失影响索赔权利。例如，货主应要求船公司出具海事声明，记录事故时间、地点及原因。

2. 合同条款审查

   • 仔细核对运输合同中关于责任限额、免责条款的约定，明确各方权利义务边界。例如，合同约定船公司对货物损失的赔偿限额为每件500美元，货主需评估是否接受该条款。

3. 专业咨询建议

   • 复杂案件可聘请海事律师提供专业指导，确保索赔策略符合国际惯例和法律规定。例如，律师可协助分析事故责任、计算损失金额并制定诉讼方案。

总结：集装箱掉入海中，船公司是否赔偿需结合事故原因、合同条款及保险情况综合判断。若您遇到此类问题，建议立即收集证据、审查合同，并根据实际情况选择协商、仲裁或诉讼途径维权。如有进一步疑问，可直接向我咨询。