结论前置：劳务派遣员工的工资支付主体主要是劳务派遣单位，但在特定情况下，用工单位也可能需承担直接支付的责任。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般情形下的工资支付主体
劳务派遣单位的责任：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十八条的规定，劳务派遣单位是用人单位，应当履行用人单位对劳动者的义务，这包括按月支付劳动报酬。因此，在一般情况下，劳务派遣员工的工资由劳务派遣单位支付。
- 劳务派遣单位与被派遣劳动者签订劳动合同，建立劳动关系，并将其派往用工单位工作。用工单位则向劳务派遣单位支付服务费用，这些费用中包含了劳动者的工资。劳务派遣单位在收到用工单位支付的费用后，应按月以货币形式向劳动者发放工资，且不得克扣或无故拖欠。
实际操作中的流程：
- 用工单位根据劳务派遣协议的约定，将包含劳动者工资在内的费用支付给劳务派遣单位。
- 劳务派遣单位在收到费用后，按照劳动合同的约定，向被派遣劳动者支付工资。
二、特殊情况下的工资支付主体
劳务派遣单位不按时支付工资：
- 在某些特殊情况下，如劳务派遣单位不按时支付工资等，用工单位可能需要根据劳务派遣协议的特别约定，直接向劳务派遣员工支付工资，以保障劳动者的合法权益。
- 这种情况相对较少见，且必须有明确的书面约定作为依据。用工单位在直接支付工资后，有权向劳务派遣单位追偿。
双方约定代发工资：
- 劳务派遣单位和用工单位可以在劳务派遣协议中明确约定，由用工单位直接代劳务派遣单位向被派遣劳动者发放工资。然而，这种约定仅改变了工资发放的操作层面，劳务派遣单位仍然对工资支付承担法定责任。
- 如果发生工资支付问题，劳务派遣单位不能以约定了用工单位代发为由逃避其法律责任。
三、劳动者权益保障
工资支付问题处理：
- 若劳务派遣单位未按时足额发放工资，劳动者有权向其主张权利，要求支付工资及相应赔偿。
- 劳动者还可以向所在地有许可管辖权的人力资源社会保障行政部门提交申请材料，进行投诉或申请劳动仲裁，以维护自身权益。
法律途径：
- 劳动者在遭遇工资支付问题时，应首先尝试与劳务派遣单位协商解决。协商无果时，可以依法向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
- 在必要时，劳动者还可以寻求法律援助或直接向我咨询，以获得更具体的法律帮助和指导。
四、实际案例与启示
- 案例：某劳务派遣员工因劳务派遣单位未按时支付工资，向劳动监察部门投诉。经调查核实后，劳动监察部门责令劳务派遣单位限期支付工资及赔偿金，并对其进行了行政处罚。
- 启示：劳务派遣员工在遇到工资支付问题时，应依法维权，通过合法途径维护自身的合法权益。同时，劳务派遣单位和用工单位也应严格遵守法律法规，切实保障劳动者的合法权益。
总结：劳务派遣员工的工资支付主体主要是劳务派遣单位，但在特定情况下，用工单位也可能需承担直接支付的责任。无论哪种支付方式，劳动者的合法权益都受到法律的严格保护。在遇到工资支付问题时，劳动者应依法维权，通过合法途径维护自身的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。