在离婚纠纷中，原告申请法院调取银行流水，被告不可以直接不同意，但被告有权对调取银行流水的申请提出异议。以下是对这一问题的详细分析：

一、法院调取银行流水的法律依据与程序

在离婚纠纷中，如果原告认为被告的银行流水与案件有关，例如涉及财产分割、隐藏或转移财产等问题，原告可以向法院提出申请，要求调取被告的银行流水。法院在审查申请后，如果认为调取银行流水对于查明案件事实、保护当事人合法权益是必要的，会依法作出调取银行流水的决定，并通知相关银行协助执行。

二、被告的权利与异议提出

1. 被告无权直接拒绝：被告不能直接拒绝法院调取其银行流水的决定。因为一旦法院作出调取决定，就具有法律效力，被告必须配合执行。

2. 被告有权提出异议：

   • 异议内容：被告可以对调取银行流水的申请提出异议，例如认为调取范围过广、与案件无关或侵犯其隐私权等。
   • 异议提出方式：被告应在收到法院调取银行流水的通知后，及时向法院提出书面异议，并说明理由。
   • 法院审查：法院会对被告的异议进行审查，并根据审查结果作出决定。如果法院认为被告的异议成立，可能会调整调取范围或撤销调取决定；如果认为异议不成立，则会继续执行调取决定。

三、被告不配合的法律后果

如果被告在收到法院调取银行流水的通知后，无正当理由拒不配合，法院可能会采取以下措施：

1. 强制执行：法院可以依法对被告进行强制执行，例如通过罚款、拘留等措施迫使被告配合调取银行流水。

2. 不利推定：在离婚纠纷中，如果被告拒不提供银行流水等关键证据，法院可能会根据现有证据和案件情况，作出对被告不利的推定。例如，法院可能会认为被告存在隐藏或转移财产的行为，从而在财产分割时给予原告更多的份额。

四、建议与注意事项

1. 积极配合：作为被告，在收到法院调取银行流水的通知后，应积极配合法院的工作，提供必要的协助。这有助于维护自己的合法权益，避免不必要的法律纠纷。

2. 及时提出异议：如果被告认为调取银行流水的申请存在不合理之处，应及时向法院提出异议，并说明理由。这有助于保护自己的合法权益，避免不必要的隐私泄露或财产损失。

3. 咨询专业律师：在处理离婚纠纷时，涉及财产分割、银行流水调取等复杂法律问题，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据案件情况，为被告提供专业的法律建议和帮助。

总结来说，在离婚纠纷中，原告申请法院调取银行流水，被告不可以直接不同意，但有权对调取申请提出异议。被告应积极配合法院的工作，并在必要时咨询专业律师的意见，以维护自己的合法权益。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。