在自然保护区内非法耕种的处罚及处罚主体如下：

1. 处罚依据与类型：

   • 行政处罚：根据《中华人民共和国自然保护区条例》第三十五条，对于在自然保护区内进行砍伐、放牧、狩猎、捕捞、采药、开垦、烧荒、开矿、采石、挖沙等活动的单位和个人，除可以依照有关法律、行政法规规定给予处罚的以外，由县级以上人民政府有关自然保护区行政主管部门或者其授权的自然保护区管理机构没收违法所得，责令停止违法行为，限期恢复原状或者采取其他补救措施；对自然保护区造成破坏的，可以处以300元以上10000元以下的罚款。
   • 刑事处罚：若非法耕种行为严重到构成犯罪，如非法占用农用地罪，则需依据《中华人民共和国刑法》第三百四十二条追究刑事责任。该条款规定，违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。

2. 处罚主体：

   • 行政处罚主体：主要是县级以上人民政府有关自然保护区行政主管部门或者其授权的自然保护区管理机构。这些机构负责自然保护区的日常管理和监督工作，有权对非法耕种等违法行为进行查处。
   • 刑事处罚主体：为司法机关，即公安机关负责侦查，人民检察院负责提起公诉，人民法院负责审判。当非法耕种行为涉嫌犯罪时，这些司法机关将依法介入，进行刑事处罚。

行动建议：

• 立即停止违法行为：若您或他人正在自然保护区内进行非法耕种，应立即停止，以避免进一步的法律后果。
• 恢复原状或采取补救措施：在停止违法行为的同时，应积极采取措施恢复被破坏的自然环境，或按照相关部门的要求采取其他补救措施。
• 配合调查与处罚：如已被相关部门发现并调查，应如实陈述事实，配合调查工作，并接受相应的处罚。

特殊场景提醒：

• 若非法耕种行为涉及多个部门管辖，如同时违反了环境保护、林业、农业等多部法律法规，则可能面临多个部门的联合处罚。
• 在某些情况下，非法耕种行为可能与其他犯罪行为交织在一起，如非法占用农用地罪与盗窃罪、破坏生产经营罪等，此时需根据具体情况进行综合判断和处罚。

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