结论概述：南新制药控股股东战略重组，若仅涉及控股股东层面且不导致公司控制权转移、不构成上市公司重大资产重组，则一般无需履行上市公司重大资产重组的特定程序，但仍需遵循公司章程、国资监管（如涉及）及证券法规的信息披露等要求。以下结合新闻背景及法律规定详细分析：

一、战略重组是否需履行特定程序，需先判断重组性质

根据《上市公司重大资产重组管理办法》，上市公司重大资产重组需履行严格程序，包括董事会决议、独立财务顾问核查、股东大会审议、证监会审核（如适用）等。但若重组仅限于控股股东层面，不涉及上市公司资产或控制权变更，则不构成“上市公司重大资产重组”，无需履行上述程序。

新闻背景中，南新制药明确表示“本次重组仅局限于控股股东层面，既不会导致公司控制权发生转移，也不构成上市公司的重大资产重组”，因此从定义上已排除重大资产重组程序。

二、控股股东战略重组仍需履行的程序

尽管不构成上市公司重大资产重组，但控股股东战略重组可能涉及以下程序：

1. 公司章程约束：若控股股东为国有企业，需遵守《企业国有资产交易监督管理办法》等国资监管规定，可能涉及产权转让审批、资产评估、公开挂牌等程序。
2. 信息披露义务：根据《证券法》及交易所规则，控股股东战略重组可能影响上市公司股权结构或经营稳定性时，上市公司需及时披露重组进展、控股股东股权变动等信息，以保障投资者知情权。
3. 内部决策程序：控股股东作为独立法人，其战略重组需履行自身公司章程规定的决策程序（如董事会、股东会决议）。

三、新闻背景中的法律风险点

1. 控制权稳定性风险：若重组过程中控股股东股权结构发生重大变化（如引入新股东、股权质押等），可能间接影响上市公司控制权稳定性。此时需关注是否触发《上市公司收购管理办法》下的权益变动披露或要约收购义务。
2. 关联交易风险：若重组后控股股东与上市公司产生新增关联交易，需遵守《公司法》《证券法》及交易所规则对关联交易的审议、披露要求，避免利益输送。
3. 信息披露合规性：上市公司需确保对控股股东重组的披露内容真实、准确、完整，避免因信息披露违规被证监会处罚或引发投资者诉讼。

四、对上市公司的建议

1. 密切跟进重组进展：要求控股股东定期通报重组方案及进展，评估对上市公司的影响。
2. 完善内控制度：针对控股股东重组可能引发的关联交易、控制权变动等风险，提前修订公司章程、关联交易管理制度等内部规则。
3. 加强投资者沟通：通过公告、互动平台等渠道，主动回应市场关切，避免股价异常波动。

延伸思考：控股股东战略重组是资本市场常见行为，但若涉及国资、跨境、复杂股权结构等情形，程序可能更复杂。上市公司及投资者需重点关注重组是否导致控制权变更、是否触发重大资产重组定义、是否涉及关联交易等核心法律问题，以评估风险并作出合理决策。如有进一步疑问，可直接向我咨询。