针对“非法营运拉客致人死亡且司机已死亡”这一情况，处理方式需结合法律责任、民事赔偿及程序衔接等多维度综合判断，具体分析如下：

1. 刑事责任层面：司机死亡导致刑事追责终止
   根据《刑事诉讼法》第16条，犯罪嫌疑人、被告人死亡的，不追究刑事责任。若司机因非法营运（如未取得营运资质擅自载客）导致事故并致人死亡，可能涉嫌交通肇事罪或以其他危险方法危害公共安全罪，但因其已死亡，刑事诉讼程序将直接终止，不再对其定罪量刑。

2. 民事赔偿层面：司机遗产继承人为赔偿主体
   根据《民法典》第1161条，继承人以所得遗产实际价值为限清偿被继承人依法应当缴纳的税款和债务。若司机留有遗产（如车辆、存款等），受害人家属可向其继承人主张赔偿，赔偿范围包括死亡赔偿金、丧葬费、被扶养人生活费等。若遗产不足以清偿全部债务，超出部分原则上不再由继承人承担（除非继承人自愿偿还）。

3. 其他责任主体：可能涉及连带赔偿

   • 平台责任：若司机通过网约车平台接单，平台未尽到审核义务（如未核实车辆营运资质），可能依据《电子商务法》第38条承担相应赔偿责任。
     
   • 车辆所有人责任：若司机驾驶的车辆登记在他人名下，且所有人明知或应知司机非法营运仍提供车辆，可能需承担连带赔偿责任。
     
   • 保险公司责任：若车辆投保了交强险或商业险，保险公司通常以“非法营运”属于免责条款为由拒赔，但若保险公司未尽到提示说明义务，可能仍需在交强险范围内承担赔偿责任（商业险一般不赔）。

4. 程序建议：家属需及时启动双重程序

   • 刑事报案：虽司机已死亡，但仍需向公安机关报案，固定事故责任认定证据（如交警出具的《交通事故责任认定书》），为后续民事诉讼提供依据。
     
   • 民事诉讼：向法院起诉司机继承人及其他责任主体，申请财产保全以防止遗产转移。若司机无遗产或遗产不足，可同时起诉平台、车辆所有人等追加赔偿主体。

总结：司机死亡导致刑事追责终止，但民事赔偿仍可通过继承遗产、追究平台或车辆所有人责任实现。家属需优先固定事故证据，并尽快启动民事诉讼程序以保障权益。若您需进一步分析具体证据或赔偿计算，可直接向我咨询。