补充协议原则上需要双方各持一份，以确保双方的权利义务明确且受到法律保护。以下从不同角度为你详细分析：

1. 合同订立的基本原理与补充协议的性质

   • 合同是双方或多方当事人意思表示达成一致的产物，体现了双方的合意。补充协议作为对原合同的补充或变更，同样需要双方的意思表示一致，即双方都应在补充协议上签字或盖章，以表明对协议内容的认可。
   • 如果只有一方持有补充协议，而另一方没有，那么当双方对协议内容产生争议时，没有协议的一方可能无法有效证明自己的权利或义务，从而面临法律风险。

2. 法律依据与补充协议的效力

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同的订立可以采用书面形式、口头形式或其他形式，但无论采用何种形式，都需要双方当事人的合意。书面形式的合同，包括合同书、信件等可以有形表现所载内容的形式，是法律所鼓励和保护的。
   • 补充协议作为书面合同的一种，其效力同样依赖于双方的合意和签字或盖章。如果只有一方签字或盖章，而另一方没有，那么该补充协议可能因缺乏双方的合意而无法产生法律效力，不能对双方产生法律约束力。

3. 实践中的操作与建议

   • 在实际操作中，为了确保补充协议的效力和避免后续纠纷，建议双方在签署补充协议时都应在协议上签字或盖章，并各自保留一份原件。这样，当双方对协议内容产生争议时，可以依据各自持有的协议原件来证明自己的权利或义务。
   • 如果因为特殊原因无法双方同时签署或保留原件，至少应确保双方都有协议的复印件或电子版，并尽可能通过其他方式（如邮件、短信等）确认双方对协议内容的认可。但这种方式的风险相对较高，因为复印件或电子版在法律上的证明力可能不如原件。

4. 特殊情况下的考量

   • 在某些特殊情况下，如果未持有补充协议的一方通过实际行动（如按照补充协议的约定履行相关义务）表明其接受了补充协议的内容，那么该补充协议可能会被认定为有效。但这种情况需要具体的证据来支持，且存在一定的法律风险。
   • 此外，如果法律另有规定或双方有特别的约定（如通过电子邮件、短信等方式确认协议内容），也可能影响补充协议的效力判断。但无论如何，双方都应尽可能保留相关的证据和记录，以备不时之需。

总结与建议：

• 补充协议原则上需要双方各持一份原件，以确保双方的权利义务明确且受到法律保护。
• 在实际操作中，建议双方在签署补充协议时都应在协议上签字或盖章，并各自保留一份原件。
• 如果因为特殊原因无法双方同时签署或保留原件，应尽可能通过其他方式确认双方对协议内容的认可，并保留相关的证据和记录。
• 如遇任何疑问或不确定之处，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供准确的法律意见和帮助。