结论：三年后发现承重墙被拆起诉退房，目前申请鉴定需满足以下条件：

1. 诉讼时效未过期
   根据《民法典》第188条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或应当知道权利受到损害之日起计算。

   • 若您在三年后才发现承重墙被拆，需证明“知道或应当知道”的时间点（如通过物业记录、邻居证言、房屋检测报告等证据），确保诉讼时效未过期。
     
   • 若超过诉讼时效，对方可能提出抗辩，导致鉴定申请或诉讼请求被驳回。

2. 鉴定目的与案件关联性
   鉴定需服务于“退房”的核心诉求，即证明承重墙被拆导致房屋结构安全不符合国家标准，或严重影响正常使用，构成根本违约。

   • 需明确鉴定事项（如房屋安全性、修复费用、贬值损失等），并与退房理由直接相关。
     
   • 若鉴定内容与案件无关（如仅鉴定装修质量），法院可能不予准许。

3. 鉴定机构资质与程序合法

   • 申请鉴定的机构需具备相应资质（如建筑工程质量检测机构资质），且通过法院委托或双方协商确定。
     
   • 鉴定程序需符合《民事诉讼法》及司法解释规定（如现场勘验、数据采集、专家论证等），确保结果客观公正。
     
   • 若对方对鉴定结果有异议，可申请重新鉴定或补充鉴定，但需符合法定条件（如鉴定机构无资质、程序违法等）。

4. 证据充分性
   申请鉴定前，需提供初步证据证明承重墙被拆的事实（如施工记录、照片、物业通知等），以及该行为与房屋安全问题的因果关系。

   • 若缺乏基础证据，法院可能以“缺乏必要性”为由驳回鉴定申请。

操作建议：

1. 立即收集证据（如房屋现状照片、物业记录、邻居证言等），固定“知道或应当知道”的时间点；
   
2. 委托专业机构出具初步检测意见（如房屋安全初步评估报告），作为鉴定申请的附件；
   
3. 在起诉时同步提交鉴定申请，明确鉴定事项、目的及机构资质要求；
   
4. 若对方抗辩诉讼时效，需通过证据反驳（如证明此前曾主张权利但被拒绝）。
   

风险提示：

• 若承重墙被拆未影响房屋主体结构安全，可能不构成退房理由，需调整诉求（如要求修复或赔偿）；
  
• 鉴定费用通常由申请人预交，最终由败诉方承担，但需以法院判决为准。
  

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