结论：醉驾被交警刑事拘留三天后移交到检察院，若检察院没有起诉到法院，是否会有案底取决于具体情形。一般来说，若检察院作出不起诉决定，则通常不会有刑事案底，但可能存在行政处罚记录。
分析说明：
刑事拘留与移交检察院：
- 醉驾行为若构成危险驾驶罪，交警部门在初步调查后，会将案件移送至检察院审查起诉。
- 刑事拘留是刑事诉讼过程中的一种强制措施，用于确保犯罪嫌疑人不逃避侦查、起诉和审判。
检察院的审查起诉：
- 检察院在收到案件后，会进行审查，决定是否对犯罪嫌疑人提起公诉。
- 若检察院认为证据不足、犯罪情节轻微或存在其他法定不起诉情形，可能会作出不起诉决定。
不起诉决定的后果：
- 刑事案底：若检察院作出不起诉决定，意味着犯罪嫌疑人未被法院判定有罪，因此通常不会有刑事案底。刑事案底是指经法院判决有罪后留下的犯罪记录。
- 行政处罚记录：然而，醉驾行为本身违反了《中华人民共和国道路交通安全法》等相关行政法规，即使检察院不起诉，交警部门仍可能根据行政法规对醉驾者进行行政处罚，如吊销驾驶证、罚款等。这些行政处罚记录虽然不属于刑事案底，但也会在个人信用记录或相关系统中留下痕迹。
特殊情况：
- 若检察院在审查过程中发现新的证据或认为案件需要进一步调查，可能会将案件退回公安机关补充侦查或自行补充侦查。在此情况下，案件可能再次被移送至法院审理。
- 若醉驾行为同时构成其他犯罪（如交通肇事罪、以危险方法危害公共安全罪等），且检察院认为需要追究刑事责任，则会提起公诉，此时醉驾者将面临刑事审判和可能的刑事案底。
行动建议：
- 了解具体情形：首先，需要了解检察院未起诉的具体原因和案件的具体情况。这有助于判断是否存在其他潜在的法律风险或后果。
- 咨询专业律师：虽然我已经提供了基本的法律分析，但每个案件都有其独特性和复杂性。因此，建议直接向我咨询，以便更详细地了解案件情况、法律风险和可能的法律后果。
- 关注行政处罚：即使检察院不起诉，也应关注交警部门可能作出的行政处罚决定，并按时履行相关义务（如缴纳罚款、接受吊销驾驶证等处罚）。
法律背景：
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条规定：“犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。”
- 《中华人民共和国道路交通安全法》等相关行政法规对醉驾行为有明确的行政处罚规定。