结论：醉驾被交警队刑事拘留三天后检察院不起诉，一般情况下不会有传统意义上的“案底”，但会留下相关记录。

详细分析：

1. “案底”的定义与影响：

   • “案底”通常指的是犯罪记录，即某人因犯罪行为被法院判决有罪后留下的记录。这种记录会对个人的社会信用、就业、出国等方面产生一定影响。
   • 在醉驾案件中，如果检察院最终决定不起诉，意味着该案件并未进入法院审判阶段，因此不会留下犯罪记录，即传统意义上的“案底”。

2. 检察院不起诉的含义：

   • 检察院不起诉是指检察院在审查起诉阶段，认为犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪，或者犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚，而作出的不起诉决定。
   • 不起诉决定意味着案件不会进入法院审判阶段，犯罪嫌疑人不会被法院判决有罪。

3. 醉驾案件中的记录问题：

   • 虽然检察院不起诉不会留下犯罪记录，但醉驾行为本身会被记录在公安机关的交通违法系统中。
   • 这些记录可能包括醉驾的违法事实、处理结果（如拘留、罚款等）以及检察院的不起诉决定等信息。
   • 这些记录虽然不属于犯罪记录，但可能在某些特定情况下（如再次违法、申请某些职业或签证等）被相关机构查询并作为参考。

4. 不同情况下的处理：

   • 如果醉驾行为情节轻微，且没有造成严重后果，检察院可能会作出相对不起诉决定。这种情况下，虽然会留下相关记录，但对个人的影响相对较小。
   • 如果醉驾行为情节严重，或者造成了严重后果（如交通事故、人员伤亡等），即使检察院最终决定不起诉，也可能因为行为本身的严重性而对个人产生较大影响。此外，如果醉驾行为被认定为危险驾驶罪（在特定条件下，如血液酒精含量达到一定标准、在高速公路上驾驶等），即使检察院不起诉，也可能面临行政处罚（如吊销驾驶证、罚款等）。

建议与后续行动：

• 如果您或您身边的人遇到了醉驾被刑事拘留后检察院不起诉的情况，建议了解并确认检察院的具体不起诉决定以及公安机关的记录情况。
• 尽管检察院不起诉不会留下犯罪记录，但仍需注意醉驾行为可能带来的其他法律后果和影响。建议遵守交通法规，杜绝酒后驾车行为。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。