在调查寻衅滋事案件时，手机是否会被收走需分情况讨论，具体如下：
作为证据收集时
若手机内存有与案件直接相关的证据（如威胁短信、挑衅视频、社交平台聊天记录等），公安机关有权依法扣押手机进行数据提取和分析。此时手机会被暂时收走，但会出具《扣押决定书》并附清单，明确扣押理由和期限。
作为涉案工具时
若手机被认定为实施寻衅滋事行为的工具（如通过群发侮辱信息、组织聚集闹事等），可能被作为物证扣押。例如，利用手机组织群体性事件或传播违法信息，手机可能被认定为作案工具。
仅作为普通物品时
若手机与案件无直接关联（如普通通讯工具且无违法内容），公安机关通常不会扣押。但若涉及其他程序（如人身检查、场所搜查），可能短暂保管，事后会及时返还。
法律依据与程序保障
根据《刑事诉讼法》第141条，公安机关扣押物品需出示搜查证或扣押证，并当场开列清单。扣押期限一般不超过30日，特殊情况可延长至60日。若手机被扣押，您有权要求办案机关出具法律文书，并可在案件终结后申请返还。
建议
若遇到手机被扣押的情况，可要求办案人员说明理由并出示法律文书，同时记录扣押时间、地点和办案人员信息。如有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。如有其他疑问，欢迎直接向我咨询。