小作坊合法经营需要办理的手续主要依据所在地区的具体法规来执行，以下以安徽省为例，为您详细介绍小作坊合法经营所需办理的手续：
一、适用范围
小作坊通常指的是有固定生产加工场所，从业人员较少、生产加工规模小、生产条件和工艺技术简单，且主要生产加工传统、特色食品的生产经营者。
二、审批依据
- 《中华人民共和国食品安全法》：该法规定了食品生产经营的基本要求和许可制度，小作坊作为食品生产经营者，需遵守相关食品安全要求。
- 《安徽省食品安全条例》：该条例明确了食品小作坊的登记制度，以及小餐饮、食品摊贩的备案制度，并规定了登记和备案不得收取费用。
三、受理机构
小作坊的登记申请通常由区级人民政府食品安全监督管理部门或者其派出机构负责受理。
四、申请条件
- 生产加工场所与有毒、有害场所和其他污染源保持安全距离。
- 生产加工区与生活区有效分隔。
- 具有相应的生产设备、设施，以及防尘、防蝇、防鼠、防虫等卫生防护设施。
- 用水符合国家规定的生活饮用水卫生标准。
- 直接从事生产加工的从业人员取得食品从业人员健康证明。
五、申请材料
- 生产加工场所平面图及其使用证明：如房产证或房屋租赁协议等。
- 拟生产的食品品种及主要生产设备、设施清单：明确您计划生产的食品种类和所需的生产设备。
- 生产加工场所的卫生与安全情况说明：描述您的生产加工场所的卫生和安全状况，包括防尘、防蝇、防鼠、防虫等措施。
- 经营者身份证明：如身份证等有效证件。
- 从业人员健康体检合格证明：确保所有直接从事生产加工的从业人员都经过健康检查并合格。
- 食品安全管理员培训考核证明（如适用）：如果您的作坊需要设立食品安全管理员，则需提供其培训考核证明。
- 营业执照：作为合法经营的凭证。
六、办理流程
- 申请：您可以通过政务服务网或到政务服务窗口提出申请，并提交上述申请材料。
- 受理：受理机构将根据您提供的材料完成材料受理工作，并一次性告知您需要补正的材料（如有）。
- 审查：受理机构将对您的书面申请材料进行审查，并可能组织审查组对您的资料和场所进行核查。
- 决定：受理机构将根据审查结果作出行政许可或者不予行政许可决定。
- 送达：如果准予许可，受理机构将制发送达食品小作坊登记证，并在法定时限内将许可决定及相应证书送达给您。
七、办理时限与费用
- 办理时限：通常为10个工作日。
- 费用：根据《安徽省食品安全条例》的规定，登记和备案不得收取费用。
八、结果送达与监督投诉
- 结果送达：您可以选择到窗口领取食品小作坊登记证，或者选择邮寄送达。
- 监督投诉电话：如果您在办理过程中遇到任何问题或需要投诉，可以拨打受理机构提供的监督投诉电话（如0554-2797345，具体号码可能因地区而异）。
请确保您的作坊符合所有相关法规和标准，以保障食品安全和消费者健康。如果您所在地区有其他特殊要求或规定，请务必遵循当地的具体法规来执行。