结论：盖过公章的文件修改字是否违法，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要根据修改的具体情况、修改后的内容以及修改的目的和影响来综合判断。
分析角度一：修改是否构成对原合同的实质性变更
若修改构成实质性变更：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同的变更应当遵循双方当事人的真实意愿，并达成一致意见。如果一方未经对方同意，擅自修改已经盖过公章的文件，且这种修改构成了对原合同的实质性变更（如改变了合同的主要条款、履行方式、价款等），那么这种修改行为可能是违法的，因为它侵犯了对方的合同权益，可能导致合同无效或产生纠纷。
若修改不构成实质性变更：
- 如果修改只是对原合同的非实质性内容进行更正或补充（如修正笔误、补充说明等），且这种修改并未改变原合同的基本框架和主要条款，那么这种修改行为可能并不违法。但即便如此，也建议双方在修改后重新确认并盖章，以避免未来可能出现的争议。
分析角度二：修改是否经过双方同意
若修改经过双方同意：
- 无论修改是否构成实质性变更，只要双方当事人都同意对已经盖过公章的文件进行修改，并重新确认了修改后的内容，那么这种修改行为就是合法的。因为合同是双方当事人之间的法律行为，只要双方意思表示一致，就可以对合同进行变更或补充。
若修改未经双方同意：
- 如果一方未经对方同意，擅自修改已经盖过公章的文件，那么这种修改行为就是违法的。因为它违反了合同法的自愿原则，侵犯了对方的合同权益。在这种情况下，受损方有权要求恢复原状、赔偿损失或采取其他法律措施来维护自己的权益。
分析角度三：修改后的文件是否产生法律效力
- 修改后的文件是否产生法律效力，取决于修改是否符合法律规定的要件。如果修改行为合法（即经过双方同意且不构成实质性变更的非法修改），那么修改后的文件将具有法律效力，双方应当按照修改后的内容履行合同。如果修改行为违法（即未经对方同意或构成实质性变更的非法修改），那么修改后的文件可能不具有法律效力，双方仍然应当按照原合同的内容履行义务。
建议：
- 在处理已经盖过公章的文件时，务必谨慎对待修改行为。如果确实需要修改，建议双方当事人先进行充分沟通并达成一致意见，然后按照法律规定的程序进行修改和确认。
- 如果对修改行为是否合法存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律意见和帮助。
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