当企业查到存在重大隐患时，应当采取以下步骤进行处理，以确保安全生产并符合相关法律法规的要求：
一、内部处理流程
立即报告：
- 企业的安全生产管理人员在检查中发现重大事故隐患后，应立即向本单位有关负责人报告。这是依据《中华人民共和国安全生产法(2021年修正)》第四十六条的规定，确保隐患能够得到及时关注和处理。
及时处理：
- 有关负责人在接到报告后，应迅速组织评估隐患的严重性和影响范围，并制定相应的处理措施。如果隐患能够立即消除，应立即采取行动；如果不能立即消除，应制定整改计划，并明确整改期限和责任人。
记录在案：
- 检查及处理情况应当如实记录在案，包括隐患的发现时间、地点、性质、处理措施、整改期限等信息。这有助于企业跟踪隐患的处理进度，并为后续的安全管理提供参考。
二、外部报告与监管措施
向监管部门报告：
- 如果企业有关负责人不及时处理重大事故隐患，安全生产管理人员可以向主管的负有安全生产监督管理职责的部门报告。这是法律赋予安全生产管理人员的权利，也是确保隐患得到及时处理的重要途径。
接受监管部门的处理：
- 监管部门在接到报告后，会依法对存在重大事故隐患的企业进行调查和处理。根据《市应急管理局行政权责清单》中的规定，监管部门可以采取停产停业、停止施工、停止使用相关设施或设备等强制措施，以确保企业的安全生产。
配合监管部门的调查与执行：
- 企业应积极配合监管部门的调查工作，提供必要的资料和证据。同时，如果监管部门决定采取强制措施，企业应依法执行，及时消除事故隐患。在整改完成后，企业应向监管部门申请解除强制措施，并接受监管部门的复查和验收。
三、后续管理与预防
完善安全管理制度：
- 企业应借此机会完善自身的安全管理制度，加强安全生产教育和培训，提高员工的安全意识和操作技能。这有助于预防类似隐患的再次发生。
定期进行安全检查：
- 企业应定期进行安全检查，及时发现并处理潜在的安全隐患。通过定期检查，企业可以确保生产过程中的安全稳定，降低事故发生的概率。
建立隐患排查治理长效机制：
- 企业应建立隐患排查治理的长效机制，将隐患排查治理工作纳入日常管理之中。通过持续改进和优化安全管理流程，企业可以不断提升自身的安全生产水平。
综上所述，当企业查到存在重大隐患时，应立即报告、及时处理、记录在案，并向监管部门报告以接受处理。同时，企业还应完善安全管理制度、定期进行安全检查、建立隐患排查治理长效机制，以确保安全生产并符合相关法律法规的要求。