若交通事故鉴定机构拒绝进行鉴定，赔偿问题需分情况处理，具体如下：

1. 鉴定机构无正当理由拒绝鉴定的处理
   根据《道路交通事故处理程序规定》第四十九条，鉴定机构无正当理由不得拒绝鉴定。若机构未说明合理理由（如超出技术能力范围、材料不完整等），您可向公安机关交通管理部门提出异议，要求其协调更换鉴定机构。若仍无法解决，可向当地司法行政部门投诉（如司法局或司法鉴定管理处），通过行政监督促使机构履行义务。

2. 因材料缺失导致鉴定被拒的补救措施
   若机构以“材料不完整”为由拒绝鉴定，您需尽快补充关键证据（如事故现场照片、医疗记录、车辆损坏照片等）。若材料已灭失或无法获取，可申请公安机关交通管理部门调取监控录像、询问证人等，完善证据链后重新申请鉴定。若证据确实无法补全，可依据现有证据（如交警责任认定书、医疗费单据等）主张赔偿，但赔偿范围可能受限。

3. 鉴定机构超期未出具结论的替代方案
   若机构超过30日未出具鉴定意见（特殊情况经批准可延长），您可要求公安机关交通管理部门出具《道路交通事故证明》，载明事故基本事实及成因无法查清的情况。此时，赔偿可通过协商或诉讼解决，法院可能根据双方过错程度、证据优势等分配责任。例如，若您能证明对方存在闯红灯、超速等违法行为，即使无鉴定结论，仍可能获赔。

4. 对鉴定结论有异议的救济途径
   若机构已出具结论但您不认可（如认为伤残等级过低），可在收到结论后3日内申请重新鉴定。重新鉴定需由原鉴定机构以外的机构进行，且费用通常由申请人预交，最终由责任方承担。若两次结论差异较大，法院可能委托第三家机构鉴定，或直接采信更合理的结论。

行动建议：

• 立即联系办案交警，要求其协调鉴定或出具事故证明；
  
• 整理所有证据（包括鉴定申请记录、机构拒鉴理由、沟通录音等），以备后续维权；
  
• 若协商无果，尽快委托律师向法院起诉，通过诉讼程序确定赔偿金额。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您分析。