结论：在合同纠纷中，若合同只在最后一页盖章，前两页未盖章，且对方声称合同前两页被替换，对方确实需要承担举证责任。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、举证责任分配原则
在民事诉讼中，举证责任通常遵循“谁主张，谁举证”的原则。即，提出某一事实主张的一方，应当承担证明该事实存在的责任。在本案例中，对方声称合同前两页被替换，这是一个积极的事实主张，因此，对方需要承担证明这一事实存在的举证责任。
二、具体举证要求
证明合同前两页与最后一页不一致：
- 对方需要提供证据证明，合同前两页的内容与最后一页（即已盖章页）的内容在逻辑上、事实上或法律上存在不一致之处。
- 这可能包括提供合同前两页的原始版本、与合同相关的其他文件或证据，以及能够证明前两页被替换的专家意见或鉴定结论等。
证明替换行为的存在：
- 对方不仅需要证明合同前两页与最后一页不一致，还需要证明这种不一致是由于替换行为导致的。
- 这可能包括提供替换行为的直接证据（如监控录像、目击者证言等）或间接证据（如合同签订过程中的异常情况、双方沟通记录等）。
三、若对方无法举证的法律后果
合同效力认定：
- 如果对方无法提供充分证据证明合同前两页被替换，那么法院或仲裁机构可能会认定合同整体有效，包括前两页和最后一页的内容。
- 这是因为，在缺乏相反证据的情况下，已盖章的合同页面通常被视为双方真实意思的表示。
责任承担：
- 如果合同被认定有效，那么双方应按照合同约定履行各自义务。
- 如果对方因无法举证而承担不利法律后果，如合同被认定有效但其主张未获支持，那么对方可能需要承担因违约或未履行合同义务而产生的法律责任。
四、建议与风险提示
对于主张合同前两页被替换的一方：
- 应尽快收集并保存所有可能证明替换行为的证据，包括合同原始版本、相关文件、沟通记录等。
- 考虑咨询专业律师，以制定合适的诉讼策略并准备充分的证据材料。
对于另一方（即已盖章方）：
- 应保留好合同原件及所有相关证据，以备不时之需。
- 如果对方提出合同前两页被替换的主张，应积极应诉并提供反驳证据，以维护自身合法权益。
进一步思考：在实际操作中，合同纠纷往往涉及复杂的法律问题和事实认定。因此，在处理此类纠纷时，建议双方均咨询专业律师，以确保自身权益得到充分保障。如果你有任何关于合同纠纷的法律问题，可以直接向我咨询。