关于承包工厂退出时费用承担的问题，这主要取决于承包合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度进行的分析：
合同有明确约定的情况：
- 如果承包合同中明确规定了退出承包时费用的承担方式，比如由哪一方承担退出费用、如何计算费用等，那么双方应当按照合同的约定来执行。这是合同自由原则的体现，也是解决此类纠纷的首要依据。
合同无明确约定或约定不明的情况：
- 协商解决：在合同没有明确约定或约定不明的情况下，双方首先应当尝试通过协商来解决费用承担的问题。协商过程中，可以参考行业惯例、市场价格以及双方的实际贡献等因素来确定费用的承担方式和金额。
- 依据法律规定：如果协商不成，那么可以依据相关法律法规的规定来处理。一般来说，如果退出承包是由于一方违约或过错导致的，那么违约方或过错方应当承担相应的费用。如果退出承包是双方协商一致的结果，且没有明确的违约或过错方，那么费用承担可能会根据双方的实际情况和公平原则来判定。
- 具体法律条款参考：虽然直接的法律条款可能并未明确提及“承包工厂退出费用承担”，但可以根据《民法典》中关于合同解除、违约责任以及公平原则等相关规定来推理和适用。例如，如果因一方违约导致合同解除，那么违约方可能需要承担因解除合同而给对方造成的损失，这包括退出承包时可能产生的费用。
特殊情况下的费用承担：
- 不可抗力因素：如果退出承包是由于不可抗力因素（如自然灾害、政策变化等）导致的，那么双方可能需要根据实际情况来协商费用的承担方式。在这种情况下，通常可能会根据公平原则来分担费用。
- 政府行为或第三方原因：如果退出承包是由于政府行为或第三方原因导致的，那么费用的承担也可能需要根据具体情况来判断。例如，如果政府要求工厂停产整顿或搬迁，那么相关费用可能由政府或相关责任方承担。
在处理此类问题时，我建议：
- 首先仔细审查承包合同中的相关条款，了解双方的权利和义务。
- 如果合同中有明确约定，则按照约定执行；如果合同无明确约定或约定不明，则尝试通过协商来解决。
- 如果协商不成，可以寻求法律途径来解决纠纷，比如通过诉讼或仲裁等方式来维护自己的合法权益。
最后需要强调的是，每个具体案件的情况都是独特的，因此在处理承包工厂退出费用承担的问题时，需要综合考虑多种因素来做出判断。如果你面临此类问题，建议直接向我咨询，以便我能根据你的具体情况提供更详细的法律建议。