结论：在公司负责人以个人名义借款，且判决由其个人承担还款责任的情况下，若想向公司主张权利，需要先判断公司是否应承担责任，若公司应承担责任，可通过协商、申请强制执行、另行起诉等途径来主张权利。以下为你详细分析：
判断公司是否应承担责任
- 是否存在表见代理情形
- 如果借款时，公司负责人虽以个人名义借款，但有证据表明相对人有理由相信其有代理权，即构成表见代理。例如，负责人长期以公司名义对外借款，公司也知晓且未提出异议；或者借款时负责人出示了公司的授权文件（虽可能是伪造，但相对人善意且无过失地相信了）等。在这种情况下，公司可能需要承担还款责任。
- 判断相对人是否善意且无过失，需要考虑交易习惯、行业惯例等因素。比如，在正常的商业往来中，如果公司负责人经常以个人名义为公司业务借款，且公司一直按时还款，那么当再次出现类似情况时，相对人就有理由相信该负责人有代理权。
- 借款是否用于公司经营
- 若能证明借款实际用于公司的生产经营活动，如用于购买原材料、支付员工工资、偿还公司债务等，那么公司可能成为实际受益人，应当承担还款责任。这需要收集相关的证据，如资金流向证明（银行转账记录显示资金进入公司账户或用于公司业务支出）、公司内部的财务记录、相关业务合同等。
- 例如，公司负责人借款后，将款项直接打入公司账户，并用于支付公司的供应商货款，且有供应商的收款凭证和公司的采购合同等证据相互印证，就可以证明借款用于了公司经营。
- 公司是否存在过错
- 如果公司在管理上存在过错，导致负责人能够以个人名义借款并使相对人产生误解，公司也可能需要承担一定的责任。比如，公司财务管理混乱，对负责人的资金使用缺乏有效监督，使得负责人有机会将个人借款与公司资金混同。
向公司主张权利的途径
- 协商解决
- 在收集到相关证据，证明公司可能应承担责任后，可以先尝试与公司进行协商。向公司说明情况，出示证据，要求公司承担相应的还款责任。协商的好处是可以节省时间和成本，避免漫长的诉讼程序，并且有可能通过友好协商达成双方都能接受的解决方案，如分期还款、债务重组等。
- 申请强制执行（若公司自愿承担或经生效法律文书确定公司责任）
- 如果通过协商，公司同意承担还款责任，可以要求公司出具书面承诺或签订还款协议。若公司不履行承诺，可以依据该书面文件向法院申请强制执行。
- 若经过诉讼等程序，法院生效法律文书确定公司应承担还款责任，在公司不履行生效法律文书确定的义务时，可以直接向法院申请强制执行公司的财产。
- 另行起诉公司
- 如果协商不成，且没有生效法律文书确定公司责任，在有充分证据证明公司应承担责任的情况下，可以以公司为被告，另行向法院提起诉讼。在诉讼过程中，要向法院提交相关证据，证明公司符合上述应承担责任的情形。法院会根据证据和法律规定进行审理，并作出判决。如果判决公司承担责任，而公司不履行判决，同样可以申请强制执行。