若在要付款时乙方公司注销了，可按以下不同情况来处理：
- 若乙方公司注销前已清算完毕
- 债权债务处理情况：根据《公司法》及相关规定，公司注销前需依法进行清算，清算组应当自成立之日起十日内通知债权人，并于六十日内在报纸上公告。债权人应当自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，向清算组申报其债权。如果乙方公司在注销前已经完成了合法的清算程序，且在清算过程中对你的债权进行了申报和处理，比如已经将应支付给你的款项列入清算债务并进行了清偿，那么此时你的付款义务可能因对方公司的合法注销而无需再履行（前提是对方已完全履行其应尽义务）。
- 后续风险防范：不过，为了确保自身权益，你可以要求清算组提供相关的清算报告、债权债务处理凭证等文件，以确认你的债权确实已经得到妥善处理。如果清算组无法提供充分的证据证明你的债权已清偿，你仍有权要求相关责任人（如清算组成员）承担相应的责任。
- 若乙方公司注销前未依法清算或存在恶意注销情形
- 追究相关责任人责任：如果乙方公司在注销前未依法进行清算，或者存在恶意注销以逃避债务的情况，根据《公司法》及相关司法解释，公司的股东、董事、控股股东和实际控制人等可能需要对公司的债务承担清偿责任。你可以收集相关证据，如合同、付款通知、对方公司注销的相关公告等，向法院提起诉讼，要求上述责任人承担付款责任。
- 申请追加被执行人：如果在你已经提起诉讼并获得胜诉判决后，乙方公司才注销的，在执行过程中，你可以向法院申请追加符合条件的股东等为被执行人，要求他们在未依法清算的范围内承担赔偿责任。
- 若存在其他特殊情况
- 合同有特别约定：如果你们双方签订的合同中有关于乙方公司注销时付款问题的特别约定，比如约定在乙方公司注销时，由其指定的第三方接收款项或者由其他关联方承担付款义务等，那么应按照合同的特别约定来处理。你需要仔细审查合同条款，并与合同中约定的相关方进行沟通和协商，要求其按照约定履行付款义务。
- 涉及第三方权益：在某些情况下，乙方公司的注销可能涉及到第三方的权益，例如乙方公司是为了某个项目而设立的项目公司，项目背后有实际的投资方或受益方。如果能够证明第三方与乙方公司的债务存在关联，且第三方从乙方公司的经营中获得了利益，你也可以尝试将第三方列为共同被告，要求其承担相应的付款责任。但这需要充分的证据支持，并且要符合法律规定的条件。