双方互附给付义务在符合一定条件下，是可以按照抵扣后结算的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律背景与原则
在合同法中，双方互负给付义务的情况并不罕见。当双方均存在对待给付义务，且这些义务在性质上能够相互抵销时，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，双方可以协商一致进行抵扣结算。这体现了合同法中的公平原则和诚实信用原则，旨在促进交易的便捷和效率，减少不必要的诉讼和纠纷。
二、抵扣结算的条件
双方协商一致：抵扣结算首先需要双方达成合意，即双方均同意按照抵扣后的金额进行结算。这是抵扣结算的前提和基础。
义务性质相同或相似：抵扣的义务应当在性质上相同或相似，以便能够相互抵销。例如，都是金钱给付义务，或者都是特定物的交付义务等。
不违反法律法规和公序良俗：抵扣结算不得违反法律法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。否则，该抵扣结算行为将被视为无效。
三、实际操作中的注意事项
明确抵扣事项和金额：在协商抵扣结算时，双方应当明确抵扣的具体事项和金额，以避免后续产生争议。这可以通过书面协议或补充协议的形式进行确认。
保留相关证据：为了证明抵扣结算的合法性和有效性，双方应当保留与抵扣事项相关的证据，如合同、发票、付款凭证等。这些证据在后续可能发生的纠纷中将起到关键作用。
及时履行抵扣后的义务：在达成抵扣结算协议后，双方应当按照协议约定的时间和方式履行各自的义务。如果一方未履行或未完全履行义务，另一方有权要求其承担违约责任。
四、可能的法律后果
如果双方未按照抵扣结算协议履行义务，或者抵扣结算协议本身存在无效情形（如违反法律法规、违背公序良俗等），那么双方可能需要承担相应的法律责任。这包括但不限于继续履行义务、赔偿损失、支付违约金等。
举例说明：假设甲和乙签订了一份买卖合同，甲应向乙支付货款10万元，乙应向甲交付价值10万元的货物。后来，双方协商一致，决定按照抵扣后的金额进行结算，即甲无需再支付货款，乙也无需再交付货物。这种抵扣结算行为在符合上述条件的情况下是合法有效的。
如果您在合同纠纷中遇到双方互附给付义务并希望进行抵扣结算的情况，建议您先与对方协商一致，并明确抵扣事项和金额。如有需要，您也可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。