关于您提出的“有案底医药代表能否备案”的问题，这主要取决于《医药代表管理办法》中的具体资质要求以及相关法律法规对于有案底人员从事特定职业的限制。

首先，我们需要明确的是，《医药代表管理办法》的发布是为了规范医药代表的学术推广行为，加强医药代表的管理，端正行业秩序，并净化行业风气。该办法对医药代表的备案提出了明确的资质要求，但这些要求主要聚焦于医药代表的专业知识、技能、经验以及职业道德等方面，并未直接提及有案底人员是否可以备案。

然而，在实际操作中，有案底的人员在备案过程中可能会面临一些额外的审查或限制。这是因为，医药代表作为医药企业与医疗机构之间的桥梁，其职业行为直接关系到公众的健康和安全。因此，相关监管部门在审核医药代表备案时，除了考虑其专业资质外，还可能会对其个人品行、诚信记录等方面进行综合评估。

具体来说，如果医药代表的案底涉及违法犯罪行为，特别是与医药行业相关的违法犯罪行为，如行贿、受贿、制假售假等，那么其备案申请很可能会被拒绝。这是因为这些行为严重违反了医药行业的职业道德和法律法规，对公众健康和安全构成了潜在威胁。

另一方面，如果医药代表的案底与医药行业无关，且其已经接受了相应的法律制裁并改正了错误，那么其备案申请是否会被接受，则取决于相关监管部门的综合评估结果。在这种情况下，医药代表需要积极配合监管部门的审查工作，提供充分的证据证明自己已经具备了从事医药代表工作的资质和条件。

综上所述，有案底的医药代表能否备案并没有一个确定的答案，而是取决于多种因素的综合考虑。因此，我建议您在申请备案前，先仔细阅读《医药代表管理办法》中的相关资质要求，并咨询当地相关监管部门或专业律师的意见，以便更准确地了解自己的备案申请是否符合要求。