哥哥有刑事案件，一般情况下妹妹能参加国家专项，但具体还需结合国家专项的要求以及哥哥刑事案件的具体情况来分析。以下从不同角度为你详细阐述：

从法律关系和资格限制角度

国家专项通常会有一定的资格要求和限制条件，这些条件主要围绕申请者自身的条件设定，比如年龄、学历、专业、户籍、经济状况等，一般不会将申请者亲属的刑事案件情况作为直接的限制因素。例如，国家助学金的申请，主要考虑的是学生本人的家庭经济困难程度、学习成绩等因素；国家公务员考试的报考，主要关注报考者自身的政治素质、道德品质、能力素质、心理素质、身体条件以及是否符合职位要求等。所以，如果妹妹符合国家专项的申请条件，哥哥的刑事案件通常不会直接影响妹妹的申请资格。

从特殊情况角度

然而，也存在一些特殊情况。某些国家专项可能对申请者的家庭背景、社会关系等方面有较为严格的审查要求，尤其是在涉及国家安全、保密等特殊领域的专项。如果哥哥的刑事案件涉及到危害国家安全、恐怖活动、黑社会性质组织犯罪等严重犯罪，且该专项与这些领域有密切关联，那么妹妹的申请可能会受到一定影响。因为相关部门在进行审查时，可能会考虑到家庭环境对申请者的影响以及潜在的风险因素。但这种情况相对较为少见，需要具体查看该国家专项的相关规定和要求。

建议

1. 详细了解国家专项的要求：妹妹在申请国家专项之前，一定要仔细阅读相关的招生简章、申请指南等文件，明确申请条件、审查标准等具体要求。如果有不清楚的地方，可以向相关部门或机构进行咨询。
2. 如实提供信息：在申请过程中，妹妹需要如实填写个人信息和家庭情况。如果哥哥的刑事案件情况可能会对申请产生潜在影响，建议妹妹提前与相关部门沟通，说明具体情况，避免因隐瞒信息而导致申请失败或后续出现问题。
3. 关注案件进展：如果哥哥的刑事案件正在审理过程中，妹妹可以关注案件的进展情况。如果案件最终被认定为不构成犯罪或情节轻微，那么对妹妹申请国家专项的影响可能会相应减小。

如果妹妹在申请国家专项过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。