关于小区内车位和物业公司约定永久使用权是否合法的问题，结论是：这种约定一般是不合法的，但具体还需根据车位的性质和产权归属来判断。以下从不同角度进行详细分析：
从车位性质来看：
- 产权车位：如果车位是产权车位，即开发商拥有车位的所有权，那么开发商有权对车位进行出售、出租或设定其他权利。但即便如此，“永久使用权”这一表述在法律上通常是不被认可的。因为“永久”意味着无限期，而法律上对于物权的行使通常是有期限限制的，比如土地使用权就有明确的年限规定。此外，如果开发商将车位以“永久使用权”的方式转让给业主，这实际上可能构成了一种变相的出售行为，但如果没有办理产权过户手续，那么这种转让在法律上可能是存在瑕疵的。
- 人防车位：如果车位是人防车位，即根据人民防空法的规定，利用地下空间建设的人防工程，在平时可以作为停车位使用。但人防车位的产权通常归国家所有，开发商或物业公司只有使用权，没有所有权。因此，他们无权将车位以“永久使用权”的方式转让给业主。
从合同效力来看：
- 即便开发商或物业公司与业主签订了关于车位“永久使用权”的合同，这种合同也可能因为违反法律、行政法规的强制性规定而被认定为无效。因为“永久使用权”的约定超出了法律对于物权行使期限的限制，损害了国家、集体或第三人的利益。
从实际操作来看：
- 在实际操作中，物业公司通常只是受开发商或业主委员会的委托，对小区进行物业管理，包括车位的出租、管理等。他们并没有权力将车位以“永久使用权”的方式转让给业主。如果物业公司这样做了，那么这种行为可能是超出了其管理权限的，业主可以对此提出异议。
法律建议：
- 对于业主来说，在购买或租赁车位时，一定要明确车位的性质和产权归属，不要轻信开发商或物业公司的“永久使用权”承诺。
- 如果已经签订了相关合同，但发现合同中存在“永久使用权”等违法条款，可以及时与开发商或物业公司协商修改合同，或者通过法律途径维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果开发商或物业公司擅自将车位以“永久使用权”的方式转让给业主，可能会面临行政处罚或民事赔偿等法律后果。
- 对于业主来说，如果购买了或租赁了这样的车位，可能会因为合同无效而面临车位被收回、租金或购买款无法退还等风险。
综上所述，小区内车位和物业公司约定永久使用权一般是不合法的。在处理这类问题时，建议业主们保持谨慎态度，必要时直接向我咨询，以维护自己的合法权益。