高校中层虚报医药费20万属于严重的职务违法甚至犯罪行为，需根据具体情节承担纪律处分、民事赔偿及刑事责任，具体处理方式如下：

1. 刑事责任层面：可能构成贪污罪或诈骗罪

• 贪污罪：若行为人利用职务便利（如负责医药费报销审核、管理公款等），通过伪造单据、虚增费用等方式非法占有公共财物，数额达到20万元，属于“数额巨大”，依据《刑法》第382条、第383条，可处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金或没收财产。
• 诈骗罪：若行为人以非法占有为目的，虚构事实（如伪造医疗记录、发票）骗取单位财物，数额特别巨大（20万元通常达到此标准），依据《刑法》第266条，可处十年以上有期徒刑或无期徒刑，并处罚金或没收财产。
• 关键区分：是否利用职务便利。若利用职务便利，优先认定为贪污罪；若未利用职务便利，则可能构成诈骗罪。

2. 纪律处分层面：高校内部处理

• 开除公职：根据《事业单位工作人员处分暂行规定》第18条，贪污、索贿、受贿、行贿、挪用公款等行为，情节严重的，给予开除处分。
• 其他处分：若情节较轻，可能给予降低岗位等级、撤职、警告、记过等处分，但20万元数额巨大，开除可能性极高。

3. 民事赔偿层面：追缴违法所得

• 高校作为受害方，可依据《民法典》第122条（不当得利）要求行为人返还虚报的20万元医药费。
• 若行为人已将款项挥霍或转移，高校可申请法院强制执行其财产（如工资、房产、存款等）。

4. 处理流程建议

• 高校内部：
  1. 立即暂停行为人职务，封存相关报销凭证、财务记录；
  2. 委托审计部门或第三方机构核查虚报金额及资金流向；
  3. 依据调查结果作出纪律处分决定，并报上级主管部门备案；
  4. 将案件移送司法机关（如监察委或公安局）处理。
• 司法机关：
  1. 公安机关立案侦查，收集证据（如发票真伪鉴定、医疗记录核实）；
  2. 检察机关审查起诉，认定罪名及量刑情节；
  3. 法院审理判决，追缴赃款并处以刑罚。

5. 特殊情形考量

• 自首情节：若行为人主动投案并退还赃款，可依据《刑法》第67条从轻或减轻处罚。
• 共同犯罪：若存在同谋或协助者（如财务人员、医生），需一并追究刑事责任。
• 单位责任：若高校财务管理存在漏洞（如审核不严），可能面临行政处罚或民事赔偿，但不影响对行为人的追责。

总结：高校中层虚报20万元医药费的行为性质恶劣，需通过刑事追责、纪律处分、民事赔偿三方面综合处理。高校应尽快启动内部调查并移送司法机关，以维护单位权益及法律尊严。如有进一步细节（如行为人职务、虚报手段等），可向我补充说明，以便更精准分析。