在执行过程中，如果发现被申请执行人失踪，这确实会给执行工作带来一定的挑战。不过，执行申请人及法院可以采取一系列措施来应对这种情况。以下是一些详细的建议和操作步骤：

一、采取财产调查措施

首先，根据《最高人民法院关于民事执行中财产调查若干问题的规定》，被执行人有义务报告其财产情况。如果被执行人失踪且未履行报告义务，执行申请人可以向法院申请发出财产申报令，责令其在指定期限内报告当前以及收到执行通知之日前一年的财产情况。同时，法院也会利用网络执行查控系统，查询被执行人的存款、债券、股票、基金份额等财产信息，并依职权调查其他可能的财产线索。

二、纳入失信被执行人名单和限制高消费

如果被执行人具有履行能力而不履行生效法律文书确定的义务，并且存在妨碍、抗拒执行或规避执行等特定情形，法院可以将其纳入失信被执行人名单，并进行信用惩戒。此外，法院还可以限制被执行人进行高消费行为，如乘坐飞机、列车软卧等高档交通工具，购买不动产或进行高档装修，旅游度假，以及子女就读高收费私立学校等。

三、申请悬赏公告查找财产

执行申请人还可以向法院申请发布悬赏公告，承诺对提供有效财产线索的人员给予一定报酬。这样，可以利用社会力量来查找被执行人的财产线索，增加执行的成功率。

四、追究拒不执行判决、裁定罪

如果被执行人有能力执行而拒不执行生效法律文书确定的义务，并且情节严重，执行申请人可以向公安机关报案。公安机关将立案侦查，并移送检察机关提起公诉。法院将根据犯罪事实和法律规定，对被执行人作出相应的刑事处罚，这包括有期徒刑、拘役或罚金等。

五、持续关注和跟进案件进展

由于被执行人失踪可能导致案件执行难度增加，执行申请人需要持续关注案件的进展情况，并与法院保持密切联系。定期向承办法官了解案件的执行进度和存在的问题，及时提供新的财产线索或被执行人行踪信息。同时，配合法院做好相关证据的收集和固定工作，为后续的强制执行措施做好准备。

综上所述，虽然被执行人失踪会给执行工作带来一定的困难，但执行申请人及法院仍然可以采取多种措施来应对。通过财产调查、纳入失信名单、限制高消费、悬赏公告以及追究刑事责任等手段，可以增加执行的成功率，维护执行申请人的合法权益。