在假冒注册商标案中，加工厂老板长期承揽加工是否认定为主犯，需根据其在共同犯罪中的具体作用、地位及参与程度综合判断，不可一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、主犯的认定标准
根据《中华人民共和国刑法》第二十六条的规定，主犯是指组织、领导犯罪集团进行犯罪活动的或者在共同犯罪中起主要作用的犯罪分子。在假冒注册商标案中，若加工厂老板不仅长期承揽加工，还负责组织、策划、指挥整个假冒注册商标活动，或者提供主要资金、设备、技术等支持，对犯罪活动的实施起到关键作用，则可能被认定为主犯。
二、加工厂老板可能被认定为主犯的情形
组织策划者：若加工厂老板是假冒注册商标活动的发起者、组织者或策划者，负责联系上下游、安排生产、销售等环节，对犯罪活动的整体实施起到决定性作用，则应被认定为主犯。
提供关键支持：若加工厂老板提供主要资金、设备、技术或原材料等，使得假冒注册商标活动得以顺利进行，且其提供的支持对犯罪活动的成功实施起到关键作用，也可能被认定为主犯。
积极参与并起主要作用：即使加工厂老板不是组织策划者，但其在假冒注册商标活动中积极参与，如负责生产、销售等关键环节，且其行为对犯罪活动的实施起到主要作用，同样可能被认定为主犯。
三、加工厂老板可能不被认定为主犯的情形
从犯或帮助犯：若加工厂老板仅按照他人的指示或要求进行加工，对假冒注册商标活动的整体实施没有决策权或控制权，且其加工行为对犯罪活动的成功实施仅起到辅助作用，则可能被认定为从犯或帮助犯。
不知情或受欺骗：若加工厂老板在不知情或受欺骗的情况下参与假冒注册商标活动，如被他人误导认为所加工的是合法商品，且其没有故意参与犯罪活动的意图，则可能不构成犯罪或仅构成轻微犯罪。
四、法律建议
对于加工厂老板：应严格遵守法律法规，不参与任何假冒注册商标活动。若已涉嫌犯罪，应积极配合调查，如实供述自己的罪行，争取从轻或减轻处罚。
对于品牌方：应加强商标保护意识，及时注册商标并维护商标权益。发现假冒注册商标行为时，应及时向公安机关报案并配合调查取证工作。
对于消费者：应提高警惕性，购买商品时仔细辨别商标真伪。发现假冒注册商标商品时，应及时向相关部门举报并维护自身合法权益。
综上所述，加工厂老板在假冒注册商标案中是否被认定为主犯需根据具体情况综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。